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Enregistrement W2913974369 · doi:10.1042/cs20181067

The first identified heterozygous nonsense mutations in podocalyxin offer new perspectives on the biology of podocytopathies

2019· letter· en· W2913974369 sur OpenAlex
Ido Refaeli, Michael R. Hughes, Kelly M. McNagny

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueClinical Science · 2019
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNonsensePodocalyxinNonsense mutationBiologyGeneticsComputational biologyMutationGeneMissense mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In the last two decades, our understanding of the genetic underpinnings of inherited podocytopathies has advanced immensely. By sequencing the genomes of a large pool of families affected by focal segmental glomerulosclerosis (FSGS), researchers have identified a common theme: familial podocytopathies are frequently caused by genes selectively expressed in podocytes. Podocalyxin is a podocyte-specific surface sialomucin that has long been known to play important roles in podocyte morphogenesis and function. Few studies, however, have shown a conclusive link between mutations in the gene and FSGS complemented by functional evidence. In a fascinating new paper published in Clinical Science, Lin et al. identify two unrelated pedigrees in which dominant loss-of-function mutations in PODXL lead to adult-onset FSGS. Nonsense-mediated decay of the mutated PODXL transcripts leads to protein insufficiency, which in turn cause podocyte dysfunction through defects in motility and cytoskeletal organization. This is the first study to date that demonstrates, mechanistically, how autosomal dominant mutations in podocalyxin can lead to FSGS and renal insufficiency. Here, we summarize the experimental findings of this manuscript and propose, perhaps, a more controversial hypothesis: down-regulation of podocalyxin protein expression from podocytes is a critical turning point in the progression of most podocytopathies and may be mechanistically relevant to glomerulopathies in which podocyte damage is not necessarily induced by genetic lesions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,517
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,004
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle