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Enregistrement W2914008487 · doi:10.1139/cjps-2018-0187

Genome-wide identification, phylogeny, and expression profile of the sucrose transporter multigene family in tobacco

2019· article· en· W2914008487 sur OpenAlexvenueno aff
Shanshan Wang, Jun Yang, Xiaodong Xie, Feng Li, Mingzhu Wu, Fu‐Cheng Lin, Zhong Wang

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyNicotiana tabacumGene familyGeneNicotianaGeneticsGenomeGene duplicationGene expression profilingAbiotic stressSegmental duplicationBotanyGene expressionSolanaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The transportation and distribution of sucrose in plants is mediated by sucrose transporters (SUTs), which also participate in various plant developmental and resistance processes. However, no such study of the tobacco SUT family has been reported yet. In the present study, 11, 5, and 4 SUT genes were identified from the genomes of Nicotiana tabacum, Nicotiana sylvestris, and Nicotiana tomentosiformis, respectively. The exon–intron structures of the tobacco SUT genes were highly conserved in the three tobacco species. Gene loss, duplication, and chromosome exchange occurred in the NtSUT family during the formation of allotetraploid common tobacco. Expression profiling analysis revealed that the expression patterns of the NtSUT genes in common tobacco were closer to those in N. sylvestris plants. The NtSUT2s and NtSUT4 genes were ubiquitously expressed in various tobacco tissues, while the NtSUT1s gene was highly expressed in the maturing leaves, indicating their functional conservation and differentiation. The transcriptions of the NtSUT2t, NtSUT3s, NtSUT4, and NtSUT5s genes in tobacco plants were dramatically induced under Pi starvation, drought, and salinity stresses, but their highest expression levels occurred in different tissues, suggesting the multiple roles of NtSUTs in plant resistance to various abiotic stresses. This study provides useful information for the further functional characterization of SUT genes in tobacco.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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