Predictive Biomarkers for Checkpoint Blockade in Urothelial Cancer: A Systematic Review
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Immune checkpoint inhibitors have had a major impact on the management of advanced urothelial cancer. Despite the impact only a minority of patients derive benefit. In this context predictive biomarkers which can assist in patient selection are needed. In this systematic review we surveyed the current biomarkers which have been investigated in clinical studies and their potential for patient selection. MATERIALS AND METHODS: We searched MEDLINE® and EMBASE®, and manually reviewed major meeting abstracts to find studies in humans of immune checkpoint inhibitors given for urothelial cancer that included biomarkers and clinical outcomes. Studies had to provide the correlation between biomarkers and outcomes to be included in analysis. Results published only in abstract form were included since several important biomarker studies have yet to be published. RESULTS: We retrieved 1,236 studies, of which 921 were unique and screened, including 144 which met criteria for full review and 25 were included in the analysis. The manual search yielded 1 additional entry not included in our systematic review for a total of 26 entries. The checkpoint inhibitors used in these studies included atezolizumab, avelumab, durvalumab, ipilimumab, nivolumab and pembrolizumab. The biomarkers tested included PD-L1 immunohistochemistry, molecular subtyping and immune gene expression analysis by RNA sequencing, targeted gene panels for mutations in DNA damage repair genes and estimation of the tumor mutational burden, genomic alterations and the total mutational burden by exome sequencing, analysis of tumor immune infiltrate by immunohistochemistry and T-cell receptor sequencing, and analysis of circulating immune cells and cytokines. CONCLUSIONS: No single biomarker has been able to accurately predict the response to immune checkpoint inhibitors. Most studies included only a treatment arm and without a comparator arm it is not possible to ascertain whether biomarkers are predictive or merely prognostic. While PD-L1 immunohistochemistry has been largely unsuccessful, other biomarkers reflecting the immunogenicity of the underlying tumor, the characteristics of the immune infiltrate and the properties of the patient immune system have shown promising data. However, all are in need of validation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,031 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,010 | 0,008 |
| Bibliométrie | 0,012 | 0,014 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».