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Enregistrement W2914174611 · doi:10.1101/536227

Non-Invasive Detection of Viral Antibodies Using Oral Flocked Swabs

2019· preprint· en· W2914174611 sur OpenAlexaff
David J. Speicher, Kathy Luinstra, Emma Smith, Santina Castriciano, Marek Smieja

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of GuelphSt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalivaMedicineAntibodyVirologyMeaslesImmunologyMeasles virusCytomegalovirusVirusVaccinationViral diseaseHerpesviridaeInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Salivary antibodies are useful in surveillance and vaccination studies. However, low antibody levels and degradation by endonucleases are problematic. Oral flocked swabs are a potential non-invasive alternative to blood for detecting viral antibodies. Serum and saliva collected from 50 healthy volunteers were stored at −80°C; dried swabs at room temperature. Seroprevalence for Cytomegalovirus (CMV), Varicella-Zoster virus (VZV), Epstein-Barr virus (EBV), Measles and Mumps IgG antibodies were determined using commercial ELISAs and processed on an automated platform. For each antibody, swabs correlated well with saliva. For CMV IgG, VZV IgG, and EBV EBNA-1 IgG and VCA IgG, the swab sensitivities compared to serum were 95.8%, 96%, 92.1% and 95.5% respectively. For Measles IgG, swab sensitivity was 84.5%. Mumps IgG displayed poor sensitivity for oral swabs (60.5%) and saliva (68.2%). Specificities for IgG antibodies were 100% for CMV, EBV and Mumps. Specificities for VZV and Measles could not be determined due to seropositive volunteers. As oral flocked swabs correlate well with serum, are easy to self-collect and stable at room temperature further research is warranted. Highlights Oral flocked swabs are an easy, self-collection method for measuring viral antibodies. Viral IgG is stable on dried oral flocked swabs for at least two years. Oral swabs are highly sensitive for CMV, VZV, and EBV IgG. Oral swabs are potentially useful for surveillance and clinical microbiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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