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Enregistrement W2914297606 · doi:10.1530/jme-18-0215

The role and possible mechanism of lncRNA AC092159.2 in modulating adipocyte differentiation

2019· article· en· W2914297606 sur OpenAlexaff
Yingdi Yuan, Xin-Guo Cao, Jiaojiao Hu, Jingyun Li, Dan Shen, Lianghui You, Xianwei Cui, Xing Wang, Yahui Zhou, Yao Gao, Lijun Zhu, Pengfei Xu, Chenbo Ji, Xirong Guo, Juan Wen

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Endocrinology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensCancer Care Ontario
Organismes subventionnairesNanjing Medical Science and Technique Development FoundationNatural Science Foundation of Jiangsu ProvinceSix Talent Peaks Project in Jiangsu ProvinceGovernment of Jiangsu ProvinceJiangsu Provincial Medical Youth TalentNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGene knockdownAdipogenesisAdipocyteWestern blotBiologyAdipose tissueEndocrinologyCell cultureGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Obesity is a major risk factor for metabolic diseases, while adipocyte differentiation is closely related to obesity occurrence. Long noncoding RNAs (lncRNAs) are a unique class of transcripts in regulation of various biological processes. Using lncRNA microarray, we found lncRNA AC092159.2 was highly expressed in differentiated HPA-v and located ~247 bp upstream of the TMEM18, which was associated with BMI and obesity. We aimed to explore the role of AC092159.2 in adipogenesis and the underlying mechanisms. The effects of AC092159.2 gain- and loss-of-function on HPA-v adipogenesis were determined with lentivirus and siRNA-mediated cell transduction, respectively. Lipid accumulation was evaluated by oil red O staining; the expression of AC092159.2, TMEM18 and several adipogenesis makers in HPA-v were analyzed by qPCR/Western blot. We found that the expression of AC092159.2 gradually increased during HPA-v differentiation, and its expression in omental adipose tissue was positively related with BMI among 48 human subjects. Overexpression of AC092159.2 promoted adipocytes differentiation while knockdown of it led to an adipogenic defect. Moreover, the expression of AC092159.2 and TMEM18 were positively correlated during adipogenic differentiation. AC092159.2 overexpression boosted TMEM18 expression while AC092159.2 knockdown restrained TMEM18 expression. Further rescue experiments showed that TMEM18 knockdown partially restrained adipogenic differentiation in AC092159.2 overexpressed HPA-v and adipogenic defect caused by AC092159.2 knockdown could be rescued by TMEM18 overexpression. Luciferase reporter assays revealed that AC092159.2 had a transcriptional activation effect on TMEM18. We concluded that lncRNA AC092159.2 promoted human adipocytes differentiation possibly by regulating TMEM18.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,478

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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