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Enregistrement W2914367013 · doi:10.3389/fimmu.2019.00084

Variable Immunogenic Potential of Wheat: Prospective for Selection of Innocuous Varieties for Celiac Disease Patients via in vitro Approach

2019· article· en· W2914367013 sur OpenAlexaff
Jasmine Grover, Parveen Chhuneja, Vandana Midha, Jean‐Eric Ghia, Dipak Deka, Chandra Sekhar Mukhopadhyay, Neena Sood, Ramit Mahajan, Arshdeep Singh, Ramneek Verma, Ekta Bansal, Ajit Sood

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCeliac Disease Research and Management
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhytohaemagglutininImmunogenicityTissue transglutaminasePeripheral blood mononuclear cellImmunologyAntigenEnteropathyGliadinBiologyT cellGlutenIn vitroMedicineImmune systemDiseaseInternal medicineFood scienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Celiac Disease is a multifactorial, autoimmune enteropathy activated by cereal proteins in genetically predisposed individuals carrying HLA DQ2/8 genes. A heterogenous gene combination of the cereal prolamins is documented in different wheat genotypes, which is suggestive of their variable immunogenic potential. In the current study, four wheat varieties (C591, C273, 9D and K78) identified via in silico analysis were analyzed for immunogenicity by measuring T-cell proliferation rate and levels of inflammatory cytokines (Interferon-γ and Tumor Necrosis Factor-α). Peripheral Blood Mononuclear Cells and biopsy derived T-cell lines isolated from four celiac disease patients in complete remission and two controls were stimulated and cultured in the presence of tissue transglutaminase activated pepsin-trypsin digest of total gliadin extract from test varieties. The immunogenicity was compared with PBW 621, one of the widely cultivated wheat varieties. Phytohaemagglutinin-p was taken as positive control, along with unstimulated cells as negative control. Rate of cell proliferation (0.318, 0.482; 0.369, 0.337), concentration of IFN- γ (107.4, 99.2; 117.9, 99.7pg/ml) and TNF- α (453.8, 514.2; 463.8, 514.2pg/ml) was minimum in cultures supplemented with wheat antigen from C273, when compared with other test varieties and unstimulated cells. Significant difference in toxicity levels among different wheat genotypes to stimulate celiac mucosal T-cells and PBMC’s was observed; where C273 manifested least immunogenic response amongst the test varieties analyzed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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