microRNA-34a (miRNA-34a) Mediated Down-Regulation of the Post-synaptic Cytoskeletal Element SHANK3 in Sporadic Alzheimer's Disease (AD)
Notice bibliographique
Résumé
Integrating a combination of bioinformatics, microRNA microfluidic arrays, ELISA analysis, LED Northern, and transfection-luciferase reporter assay data using human neuronal-glial (HNG) cells in primary culture we have discovered a set of up-regulated microRNAs (miRNAs) linked to a small family of down-regulated messenger RNAs (mRNAs) within the superior temporal lobe neocortex (Brodmann A22) of sporadic Alzheimer's disease (AD) brain. At the level of mRNA abundance, the expression of a significant number of human brain genes found to be down-regulated in sporadic AD neocortex appears to be due to the increased abundance of a several brain-abundant inducible miRNAs. These up-regulated miRNAs-including, prominently, miRNA-34a-have complimentary RNA sequences in the 3' untranslated-region (3'-UTR) of their target-mRNAs that results in the pathological down-regulation in the expression of important brain genes. An up-regulated microRNA-34a, already implicated in age-related inflammatory-neurodegeneration-appears to down-regulate key mRNA targets involved in synaptogenesis and synaptic-structure, distinguishing neuronal deficits associated with AD neuropathology. One significantly down-regulated post-synaptic element in AD is the proline-rich SH3 and multiple-ankyrin-repeat domain SHANK3 protein. Bioinformatics, microRNA array analysis and SHANK3-mRNA-3'UTR luciferase-reporter assay confirmed the importance of miRNA-34a in the regulation of SHANK3 expression in HNG cells. This paper reports on recent studies of a miRNA-34a-up-regulation coupled to SHANK3 mRNA down-regulation in sporadic AD superior-temporal lobe compared to age-matched controls. These findings further support our hypothesis of an altered miRNA-mRNA coupled signaling network in AD, much of which is supported, and here reviewed, by recently reported experimental-findings in the scientific literature.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».