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Enregistrement W2914547283 · doi:10.1111/apt.15141

Comparison of the metabolomic profiles of irritable bowel syndrome patients with ulcerative colitis patients and healthy controls: new insights into pathophysiology and potential biomarkers

2019· article· en· W2914547283 sur OpenAlexafffund
Ammar Hassanzadeh Keshteli, Karen Madsen, Rupasri Mandal, Guy E. Boeckxstaens, Přemysl Berčík, Giada De Palma, David E. Reed, David S. Wishart, Stephen Vanner, Levinus A. Dieleman

Notice bibliographique

RevueAlimentary Pharmacology & Therapeutics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensQueen's UniversityMcMaster UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Innovates Bio SolutionsAlberta Innovates - Health Solutions
Mots-clésIrritable bowel syndromeMedicineUlcerative colitisGastroenterologyInternal medicinePathophysiologyUrinary systemMetabolomicsUrineMetabolomeDiseaseMetaboliteBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Evaluation of the metabolomic profile of patients with irritable bowel syndrome offers an opportunity to identify novel pathophysiological targets and biomarkers that could discriminate this disorder from related conditions. AIM: To identify potential urinary biomarkers that discriminate irritable bowel syndrome patients from ulcerative colitis patients in remission and healthy controls and to explore the pathophysiology of irritable bowel syndrome using a metabolomic approach. METHODS: Urine samples were collected from 39 irritable bowel syndrome patients, 53 ulcerative colitis patients in clinical remission and 21 healthy controls. Urinary metabolites were identified and quantified using direct infusion/liquid chromatography tandem mass spectrometry and gas-chromatography mass spectrometry. RESULTS: Patients with irritable bowel syndrome had a unique urinary metabolome that could separate them from ulcerative colitis patients with an area under the curve = 0.99 (95% confidence interval 0.95-1.00). The most important metabolites for this separation were a group of amino acids and organic acids. In addition, subjects with irritable bowel syndrome could be discriminated from healthy controls using their metabolic fingerprints. Irritable bowel syndrome patients had lower urinary Phosphatidyl choline acyl-alkyl C38:6, dopamine and p-hydroxybenzoic acid than healthy controls. Levels of some urinary metabolites including histamine correlated significantly with irritable bowel syndrome symptom severity scores. CONCLUSIONS: Irritable bowel syndrome patients have a unique urinary metabolomic profile compared to ulcerative colitis patients in clinical remission or healthy subjects. These data suggest that metabolomic profiling may provide important insights into pathophysiology and testable biomarkers to discriminate irritable bowel syndrome from other disorders that can mimic this condition and can be used to assess its severity and identify potential novel pathophysiological pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,389
Score d'incertitude au seuil0,643

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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