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Enregistrement W2914578654 · doi:10.14309/00000434-201710001-00622

Clostridium difficile Infections Among Hospitalized Individuals With IBD

2017· article· en· W2914578654 sur OpenAlexaffabout
Harminder Singh, Zoann Nugent, Nancy Yu, Lisa M. Lix, Laura E. Targownik, Charles Bernstein

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineEpidemiologyClostridium difficileProportional hazards modelHazard ratioConfidence intervalPopulationPublic healthSurveillance, Epidemiology, and End ResultsInternal medicineEnvironmental healthPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Much of the information on the epidemiology of Clostridium difficile Infections (CDI) in North America comes from an assessment of hospital discharge databases (DAD), using the International Classification of Diseases code for CDI. We have recently reported hospital discharge abstracts have limited accuracy in identifying occurrence of CDI among hospitalized individuals with IBD. However the impact of this misclassification on the assessment of time trends and CDI epidemiology among individuals with IBD remains unknown. Methods: The University of Manitoba IBD Epidemiology Database was used to identify individuals with and without IBD and DAD CDI diagnosis (07/01/2005-3/31/2014), who were matched on age, sex and area of residence. The Manitoba Health Public Health Branch Epidemiology and Surveillance population-based CDI dataset was used to identify laboratory confirmed CDI cases. Joinpoint Regression program developed by SEER was used to assess the time trends of CDI rates. Cox proportional hazards regression models were used to determine the relative risks (estimated as hazard ratios (HRs) and corresponding confidence intervals (CIs) of CDIs (first episode) among individuals with and without IBD. Nested case control study was performed to determine predictors of CDI among individuals with IBD. Results: CDI assessment from DAD showed an increase in CDI rates among hospitalized individuals with IBD (Annual percent change (APC): 5.31; p=0.02), in contrast to no significant change in the assessment from lab CDI dataset (APC: -1.62; p=0.61) (figure 1). There was no significant change among individuals without IBD (DAD APC: -4.48; p=0.06; Lab dataset APC -6.34; p=0.07). This resulted in apparent increase in rate ratio of CDI among those with IBD vs. those without IBD in the DAD, but not with the Lab dataset (figure 2). DAD assessment suggested a much more increased risk of CDI among young individuals with IBD than the lab CDI dataset (figure 3). The nested case control suggested short duration of IBD (within first year) was a much more marked risk factor for CDI in the DAD analysis (OR 27.1; 95% CI: 7.7-95.9) than in the lab CDI analysis. Conclusion: Results of studies using ICD codes to study epidemiology of Clostridium difficile infections among those with IBD should be viewed with caution. Incidence of Clostridium difficile infections is not increasing among hospitalized patients with IBD.FigureFigureFigure

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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