Long noncoding RNA LINC00520 prevents the progression of cutaneous squamous cell carcinoma through the inactivation of the PI3K/Akt signaling pathway by downregulating EGFR
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Long noncoding RNAs (lncRNAs) play pivotal roles in various malignant tumors. Epidermal growth factor receptor (EGFR) signaling is associated with the pathogenesis of cutaneous squamous cell carcinoma (cSCC). This study aimed to explore the role of LINC00520 in the development of cSCC via EGFR and phosphoinositide 3-kinase-protein kinase B (PI3K/Akt) signaling pathways. METHODS: A microarray analysis was applied to screen differentially expressed lncRNAs in cSCC samples. The A431 cSCC cell line was transfected and assigned different groups. The expression patterns of LINC00520, EGFR, and intermediates in the PI3K/Akt pathway were characterized using reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) and Western blotting analysis. Cell proliferation, migration, and invasion were detected using the MTT assay, scratch test, and Transwell assay, respectively. Cell-based experiments and a tumorigenicity assay were conducted to assess the effect of LINC00520 on cSCC progression. This study was ended in September 2017. Comparisons between two groups were analyzed with t-test and comparisons among multiple groups were analyzed using one-way analysis of variance. The nonparametric Wilcoxon rank sum test was used to analyze skewed data. The enumerated data were analyzed using the chi-square test or Fisher exact test. RESULTS: Data from chip GSE66359 revealed depletion of LINC00520 in cSCC. Cells transfected with LINC00520 vector and LINC00520 vector + si-EGFR showed elevated LINC00520 level but decreased levels of the EGFR, PI3K, AKT, VEGF, MMP-2 and MMP-9 mRNAs and proteins, and inhibition of the growth, migration and adhesion of cSCC cells, while the si-LINC00520 group showed opposite trends (all P < 0.05). Compared with the LINC00520 vector group, the LINC00520 vector + si-EGFR group showed decreased levels of the EGFR, PI3K, AKT, VEGF, MMP-2 and MMP-9 mRNAs and proteins, and inhibition of the growth, migration and adhesion of cSCC cells, while the LINC00520 vector + EGFR vector group showed opposite results (all P < 0.05). CONCLUSION: Based on our results, LINC00520-targeted EGFR inhibition might result in the inactivation of the PI3K/Akt pathway, thus inhibiting cSCC development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».