Utilizing DNA metabarcoding to characterize the diet of marine-phase Arctic lamprey (<i>Lethenteron camtschaticum</i>) in the eastern Bering Sea
Notice bibliographique
Résumé
To understand the marine feeding ecology of Arctic lamprey (Lethenteron camtschaticum) in the eastern Bering Sea, visual observations and DNA metabarcoding of gut contents (N = 250) were used to characterize Arctic lamprey diet composition in 2014 and 2015. Differences among individual diets were evaluated by collection year, capture site, and fish size. Hard structures and tissues were observed during visual examinations of gut contents, and 10 ray-finned fish taxa were identified by DNA metabarcoding. The most frequently observed taxa included capelin (Mallotus villosus), Pacific herring (Clupea pallasii), Pacific sand lance (Ammodytes hexapterus), and gadids. Six taxa were reported for the first time as prey for Arctic lamprey. Individual diets differed between collection years, among capture sites, and among size classes; however, both collection year and size class explained only a small portion of diet variability (R 2 = 0.01 and 0.04, respectively) relative to capture site (R 2 = 0.49). These study results indicate that Arctic lamprey is a flesh-feeding species and highlight the value of DNA metabarcoding to characterize the diet of a poorly understood lamprey species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».