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Enregistrement W2914805249 · doi:10.1074/jbc.ra119.007494

O-GlcNAcylation alters the selection of mRNAs for translation and promotes 4E-BP1–dependent mitochondrial dysfunction in the retina

2019· article· en· W2914805249 sur OpenAlexfundno aff
Sadie K. Dierschke, William P. Miller, John Favate, Premal Shah, Yuka Imamura Kawasawa, Anna C. Salzberg, Scot R. Kimball, Leonard S. Jefferson, Michael D. Dennis

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institutes of HealthJohns Hopkins UniversityPennsylvania State UniversityNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of PennsylvaniaWeill Cornell Medical CollegeMcGill UniversityNational Eye InstituteNational Institute of General Medical SciencesAmerican Diabetes Association
Mots-clésEukaryotic initiation factorEIF4ESOD2Initiation factorBiologyCell biologyTranslation (biology)Protein biosynthesisEukaryotic translationRetinaMessenger RNAMolecular biologyChemistryBiochemistrySuperoxide dismutaseGeneOxidative stress

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diabetes promotes the posttranslational modification of proteins by O- linked addition of GlcNAc ( O- GlcNAcylation) to Ser/Thr residues of proteins and thereby contributes to diabetic complications. In the retina of diabetic mice, the repressor of mRNA translation, eIF4E-binding protein 1 (4E-BP1), is O- GlcNAcylated, and sequestration of the cap-binding protein eukaryotic translation initiation factor (eIF4E) is enhanced. O- GlcNAcylation has also been detected on several eukaryotic translation initiation factors and ribosomal proteins. However, the functional consequence of this modification is unknown. Here, using ribosome profiling, we evaluated the effect of enhanced O- GlcNAcylation on retinal gene expression. Mice receiving thiamet G (TMG), an inhibitor of the O- GlcNAc hydrolase O- GlcNAcase, exhibited enhanced retinal protein O- GlcNAcylation. The principal effect of TMG on retinal gene expression was observed in ribosome-associated mRNAs ( i.e. mRNAs undergoing translation), as less than 1% of mRNAs exhibited changes in abundance. Remarkably, ∼19% of the transcriptome exhibited TMG-induced changes in ribosome occupancy, with 1912 mRNAs having reduced and 1683 mRNAs having increased translational rates. In the retina, the effect of O- GlcNAcase inhibition on translation of specific mitochondrial proteins, including superoxide dismutase 2 (SOD2), depended on 4E-BP1/2. O- GlcNAcylation enhanced cellular respiration and promoted mitochondrial superoxide levels in WT cells, and 4E-BP1/2 deletion prevented O- GlcNAcylation–induced mitochondrial superoxide in cells in culture and in the retina. The retina of diabetic WT mice exhibited increased reactive oxygen species levels, an effect not observed in diabetic 4E-BP1/2–deficient mice. These findings provide evidence for a mechanism whereby diabetes-induced O- GlcNAcylation promotes oxidative stress in the retina by altering the selection of mRNAs for translation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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