Kinetics of competitive Cd2+ binding pathways: the realistic structure of intrinsically disordered, partially metallated metallothioneins
Notice bibliographique
Résumé
The 20-cysteine mammalian metallothioneins are considered to be central to the homeostatic control of the essential metals Zn(ii) and Cu(i) and, as part of their metal-loaded status, play a role in reversing oxidative stress. Native apo-MT does not adopt a well-known structural motif, being described as a random-coil or intrinsically-disordered. Conclusions reached from a combination of ESI-mass spectral charge states, As(iii) metallation of apo-MT at low pH, from molecular dynamic calculations and from metallation of the α-domain fragment, suggest that in fact the native apo-MT adopts a structure that is highly efficient towards metallation at physiological pH. The results in this paper show that the initial (M < 5) Cd(ii) metallation at physiological pH takes place to form structures based on isolated Cd(SCYS)4 units, beads. At pH 5, cysteine bridged Cd4(SCYS)11 clusters form. ESI-mass spectral profile of cysteine modification of apo-MT at physiological pH shows that it is folded, whereas in the presence of 3 M guandinium hydrochloride the apo-MT is unfolded. Stopped flow kinetic studies of the Cd(ii) metallation shows that the reaction is much slower for the unfolded vs. the folded apo-MT for formation of either beads or clusters. Metallation is also much slower for the formation of clusters than the formation of beads. These results are first to quantify the presence of structure in native apo-MT in terms of the critical metallation properties. The implications of this study suggest that oxidation of apo-MT due to ageing or other agent will negatively impact the metallation process for essential metals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».