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Enregistrement W2915005985 · doi:10.1074/jbc.ra118.005301

The malate-activated ALMT12 anion channel in the grass Brachypodium distachyon is co-activated by Ca2+/calmodulin

2019· article· en· W2915005985 sur OpenAlexafffund
Khanh Luu, Nandhakishore Rajagopalan, John C.H. Ching, Michèle C. Loewen, Matthew E. Loewen

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAluminum toxicity and tolerance in plants and animals
Établissements canadiensQueen's UniversityNational Research Council CanadaSaskatchewan Research Council (Canada)University of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésBrachypodium distachyonGuard cellCalmodulinBiochemistryBiologyBiophysicsCell biologyChemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In plants, strict regulation of stomatal pores is critical for modulation of CO 2 fixation and transpiration. Under certain abiotic and biotic stressors, pore closure is initiated through anionic flux, with calcium (Ca 2 ) playing a central role. The aluminum-activated malate transporter 12 (ALMT12) is a malate-activated, voltage-dependent member of the aluminumactivated malate transporter family that has been implicated in anionic flux from guard cells controlling the stomatal aperture. Herein, we report the characterization of the regulatory mechanisms mediating channel activities of an ALMT from the grass Brachypodium distachyon (BdALMT12) that has the highest sequence identity to Arabidopsis thaliana ALMT12. Electrophysiological studies in a heterologous cell system confirmed that this channel is malate-and voltage-dependent. However, this was shown to be true only in the presence of Ca 2 . Although a general kinase inhibitor increased the current density of BdALMT12, a calmodulin (CaM) inhibitor reduced the Ca 2dependent channel activation. We investigated the physiological relevance of the CaM-based regulation in planta, where stomatal closure, induced by exogenous Ca 2 ionophore and malate, was shown to be inhibited by exogenous application of a CaM inhibitor. Subsequent analyses revealed that the double substitutions R335A/R338A and R335A/K342A, within a predicted BdALMT12 CaM-binding domain (CBD), also decreased the channels' ability to activate. Using isothermal titration calorimetry and CBD-mimetic peptides, as well as CaM-agarose affinity pulldown of full-length recombinant BdALMT12, we confirmed the physical interaction between the CBD and CaM. Together, these findings support a co-regulatory mechanism of BdALMT12 activation by malate, and Ca 2 /CaM, emphasizing that a complex regulatory network modulates BdALMT12 activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,153
Score d'incertitude au seuil0,372

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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