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Enregistrement W2915025950 · doi:10.1101/535039

Septin 9-containging filaments and Golgi assembly depend on two polybasic domains

2019· preprint· en· W2915025950 sur OpenAlexfundno aff
Mohyeddine Omrane, Amanda Souza Câmara, Cyntia Taveneau, Nassima Benzoubir, Thibault Tubiana, Jinchao Yua, Raphaël Guérois, Didier Samuel, Bruno Goud, Christian Poüs, Stéphane Bressanelli, Richard Charles Garratt, Abdou Rachid Thiam, Ama Gassama‐Diagne

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversité de Recherche Paris Sciences et LettresAssociation pour la Recherche sur le CancerQueen's UniversityStyrelsen för Internationellt UtvecklingssamarbeteUniversité Paris-SudAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésSeptinCell biologyGolgi apparatusOrganelleMembraneBiologyGTPaseC2 domainCytokinesisChemistryBiochemistryCell divisionEndoplasmic reticulumCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Septins are GTP-binding proteins involved in several membrane remodeling mechanisms. They associate with membranes, presumably by using a polybasic domain (PB1) that interacts with phosphoinositides (PIs). Membrane-bound septins assemble into microscopic structures that regulate membrane shape. How septins exactly interact with PIs, assemble, and shape membranes is weakly understood. Here, we found that septin 9 has a second polybasic domain (PB2) conserved in the human septin family. Similarly to PB1, PB2 binds specifically to PIs, and both domains are critical for septin filament formation. However, septin 9 membrane association does not depend on these PB domains but on putative PB-adjacent amphipathic helices. The presence of the PB domains guarantees the protein enrichment to PI-contained membranes, which is critical for PI-enriched organelles. In particular, we found that septin 9 PB domains control the assembly and functionality of the Golgi apparatus. Our findings bring novel insights into the role of septins in organelle morphology. Highlights Two polybasic domains mediate septin 9 interaction with PIs Human septins have amphipathic helices suitable for binding membrane Septin 9 polybasic domains mediate septin high order structure formation Mutation or depletion of septin polybasic domains induce Golgi fragmentation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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