Demographic responses underlying eco‐evolutionary dynamics as revealed with inverse modelling
Notice bibliographique
Résumé
Changes in population dynamics due to interacting evolutionary and ecological processes are the direct result of responses in vital rates, that is stage-specific growth, survival and fecundity. Quantifying through which vital rates population fitness is affected, instead of focusing on population trends only, can give a more mechanistic understanding of eco-evolutionary dynamics. The aim of this study was to estimate the underlying demographic rates of aphid (Myzus persicae) populations. We analysed unpublished stage-structure population dynamics data of a field experiment with caged and uncaged populations in which rapid evolutionary dynamics were observed, as well as unpublished results from an individual life table experiment performed in a glasshouse. Using data on changes in population abundance and stage distributions over time, we estimated transition matrices with inverse modelling techniques, in a Bayesian framework. The model used to fit across all experimental treatments included density as well as clone-specific caging effects. We additionally used individual life table data to inform the model on survival, growth and reproduction. Results suggest that clones varied considerably in vital rates, and imply trade-offs between reproduction and survival. Responses to densities also varied between clones. Negative density dependence was found in growth and reproduction, and the presence of predators and competitors further decreased these two vital rates, while survival estimates increased. Under uncaged conditions, population growth rates of the evolving populations were increased compared to the expectation based on the pure clones. Our inverse modelling approach revealed how much vital rates contributed to the eco-evolutionary dynamics. The decomposition analysis showed that variation in population growth rates in the evolving populations was to a large extent shaped by plant size. Yet, it also revealed an impact of evolutionary changes in clonal composition. Finally, we discuss that inverse modelling is a complex problem, as multiple combinations of individual rates can result in the same dynamics. We discuss assumptions and limitations, as well as opportunities, of this approach.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».