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Enregistrement W2915611428 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-18-4099

Clonotypic Diversity of the T-cell Receptor Corroborates the Immature Precursor Origin of Cutaneous T-cell Lymphoma

2019· article· en· W2915611428 sur OpenAlex
Abdelbasset Hamrouni, H Fogh, Zoulika Zak, Niels Ødum, Robert Gniadecki

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCutaneous lymphoproliferative disorders research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNovo Nordisk FondenUniversity of AlbertaKræftens BekæmpelseCanadian Dermatology Foundation
Mots-clésLymphomaBiologyReceptorCellImmunologyCancer researchGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Mycosis fungoides is one of the most common types of extranodal T-cell lymphomas, considered to be caused by malignant transformation of the mature T cells residing in the skin. However, some clinical observations such as the multifocal distribution of mycosis fungoides lesions or patterns of relapse after radiotherapy are not readily explainable by the mature T-cell origin theory. EXPERIMENTAL DESIGN: We have performed a detailed analysis of T-cell receptor (TCR) rearrangements in single malignant cells and in biopsies from mycosis fungoides tumors composed of >80% of malignant cells using next-generation sequencing (NGS) to pinpoint the relationship between neoplastic cells in mycosis fungoides. We have also aimed to detect malignant, circulating T-cell by whole blood TCR sequencing. RESULTS: We found a substantial clonal heterogeneity in the mycosis fungoides samples with regards to TCR, and we demonstrated that lymphoma cells harboring identical TCRγ sequences may harbor different TCRα and β sequences. Lack of absolute TCRα, -β, -γ monoclonality was further confirmed by TCR amplification and sequencing from microdissected lymphoma cells. We have also found the TCR rearrangements characteristic for lymphoma cells in patients' peripheral blood despite the lack of leukemic blood involvement; however, the circulating TCRγ clonotype did not always represent the dominant cutaneous clonotype. CONCLUSIONS: These findings can be explained by a model where malignant transformation takes place during early T-cell development giving rise to circulating premalignant clones, which home to the skin producing clinically apparent lesions of cutaneous lymphoma. Therapeutic strategies in T-cell lymphoma should therefore target those early lymphoma precursor cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,697
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle