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Enregistrement W2915887926 · doi:10.1371/journal.pone.0212544

Genetic improvement of hip-extended scores in 3 breeds of guide dogs using estimated breeding values: Notable progress but more improvement is needed

2019· article· en· W2915887926 sur OpenAlexaboutno aff
Eldin A. Leighton, Dolores M. Holle, Darryl N. Biery, Thomas P. Gregor, Mischa B. McDonald‐Lynch, Mandy L. Wallace, Jennifer K. Reagan, Gail K. Smith

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueVeterinary Equine Medical Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of PennsylvaniaMorris Animal Foundation
Mots-clésStatisticsBiologyMedicineMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two hip quality phenotypes-a hip-extended score assigned by a board certified radiologist and the PennHIP distraction index-were analyzed to estimate genetic parameters and to calculate estimated breeding values used for selecting replacement breeders. Radiographs obtained at 12-18 months of age were available on 5,201 German Shepherd Dogs, 4,987 Labrador Retrievers and 2,308 Golden Retrievers. Obtained by fitting a two-trait model using Bayesian techniques, estimates of heritability for the hip-extended score were 0.76, 0.72, and 0.41 in German Shepherd Dogs, Labrador Retrievers, and Golden Retrievers, respectively, while estimated heritabilities for distraction index were 0.60, 0.66 and 0.59, respectively. Genetic correlations between the two hip quality measures were -0.28 in German Shepherd Dogs, -0.21 in Labrador Retrievers, and -0.29 in Golden Retrievers. Genetic selection for improved hip quality based upon the hip extended score phenotype began in 1980. Among first generation puppies, 34% of 273 German Shepherd Dogs, 55% of 323 Labrador Retrievers, and 43% of 51 Golden Retrievers had an Excellent hip extended score. After 8 generations of selection, mostly based on estimated breeding values derived from the hip extended score, over 93% of 695 German Shepherd Dogs, 94% of 528 Labrador Retrievers, and 87% of 116 Golden Retrievers received an Excellent hip extended score. With respect to PennHIP distraction index values among these same dogs, median values were at or above 0.30 for all 3 breeds meaning that half or more of dogs possessing the Excellent hip-extended-score phenotype remained susceptible to developing the osteoarthritis of canine hip dysplasia. Genetic improvement of the hip-extended-view phenotype to its desired biological endpoint left a surprising proportion of dogs expressing sufficient joint laxity to place them in an osteoarthritis at-risk state as they age. Only by directly applying selection pressure to reduce distraction index was marked reduction in joint laxity noted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,145
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2019
Routes d'admission1
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