An objective flow cytometry method to rapidly determine cord blood potency in cryopreserved units
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Cord blood banks have to determine the regenerative potential of cord blood units (CBUs) on a representative sample of the cryopreserved product before release to the transplant center. Potency can be measured by using a colony-forming unit (CFU) method, which delays the release of CBU by 7 to 14 days. To accelerate CBU qualification, we have developed a rapid method to assess the response of CD34 cells to interleukin (IL)-3. Flow cytometry was used to measure IL-3-induced STAT5 phosphorylation within CD34-cells. This IL-3 test was compared to the CFU method, as well as the aldehyde dehydrogenase (ALDH) enzyme-based assay. STUDY DESIGN AND METHODS: cells, and IL-3-responsive CD34+ cells. Extreme and mild warming event scenarios were simulated on CBUs and used as poor-quality samples. Segments, tubes, and bags from five CBUs were compared for their potency using IL-3 and CFU methods. RESULTS: The IL-3 test was accurate in identifying the samples handled following standard operating procedures and those subjected to extreme warming events. Based on these results, a threshold of 55% of IL-3-responsive CD34 cells was established to identify good-quality samples. The IL-3 test was also the most sensitive to detect samples subjected to milder warming events. CONCLUSIONS: Our new method for determining CBU functionality is rapid, unbiased, and robust. The IL-3 test described herein fulfills the requirements for validation, and we intend to implement this method in our cord blood bank facility.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».