Genetic Diversity and Structure in Regional<i>Cercospora beticola</i>Populations from<i>Beta vulgaris</i>subsp.<i>vulgaris</i>Suggest Two Clusters of Separate Origin
Notice bibliographique
Résumé
Cercospora leaf spot, caused by Cercospora beticola, is a highly destructive disease of Beta vulgaris subsp. vulgaris worldwide. C. beticola populations are usually characterized by high genetic diversity, but little is known of the relationships among populations from different production regions around the world. This information would be informative of population origin and potential pathways for pathogen movement. For the current study, the genetic diversity, differentiation, and relationships among 948 C. beticola isolates in 28 populations across eight geographic regions were investigated using 12 microsatellite markers. Genotypic diversity, as measured by Simpson’s complement index, ranged from 0.18 to 1.00, while pairwise index of differentiation values ranged from 0.02 to 0.42, with the greatest differentiation detected between two New York populations. In these populations, evidence for recent expansion was detected. Assessment of population structure identified two major clusters: the first associated with New York, and the second with Canada, Chile, Eurasia, Hawaii, Michigan, North Dakota, and one population from New York. Inferences of gene flow among these regions suggested that the source for one cluster likely is Eurasia, whereas the source for the other cluster is not known. These results suggest a shared origin of C. beticola populations across regions, except for part of New York, where population divergence has occurred. These findings support the hypothesis that dispersal of C. beticola occurs over long distances.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».