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Enregistrement W2916620889

Mendelian Sampling variance tests with genomic preselection

2019· article· en· W2916620889 sur OpenAlexaffabout
P G Sullivan

Notice bibliographique

RevueBulletin - International Bull Evaluation Service/Interbull bulletin · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensCanadian Dairy Commission
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMendelian inheritanceVariance (accounting)BiologyStatisticsTest (biology)Computer scienceGeneticsMathematicsAccountingGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interbull has introduced a new validation test, and provided corresponding software to detect non-zero time trends and outliers years, for estimates of genetic variance.  The test is applied separately for cows and AI sires, for all traits included in the Interbull MACE evaluation service.  In recent years, AI sires have been genomically preselected, using genotype-based evaluations when they were young calves.  Genomic preselection significantly changes the expectation of Mendelian sampling distributions for AI bulls.  The new Interbull test is applied to EBV computed without genotypes, which are biased by ignored genomic preselection effects.  The purposes of the present study were to apply the new validation test to Canadian data, firstly using official EBV submitted for MACE, and secondly using corrected EBV, after making adjustments to reduce preselection biases in the MS distributions of the most recent AI bulls.  For the main traits under selection in Canada, test results were a pass for official EBV, but a fail for bias-corrected EBV.  For bull populations with genomic preselection, biased EBV are expected to pass the test, while unbiased data are expected to fail.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,720
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0150,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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