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Enregistrement W2916864964 · doi:10.1371/journal.pcbi.1006108

A computational model of epithelial solute and water transport along a human nephron

2019· article· en· W2916864964 sur OpenAlexaff
Anita T. Layton, Harold E. Layton

Notice bibliographique

RevuePLoS Computational Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesDirectorate for Mathematical and Physical SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesFoundation for the National Institutes of HealthNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésNephronChemistryBiophysicsBiological systemComputational biologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have developed the first computational model of solute and water transport from Bowman space to the papillary tip of the nephron of a human kidney. The nephron is represented as a tubule lined by a layer of epithelial cells, with apical and basolateral transporters that vary according to cell type. The model is formulated for steady state, and consists of a large system of coupled ordinary differential equations and algebraic equations. Model solution describes luminal fluid flow, hydrostatic pressure, luminal fluid solute concentrations, cytosolic solute concentrations, epithelial membrane potential, and transcellular and paracellular fluxes. We found that if we assume that the transporter density and permeabilities are taken to be the same between the human and rat nephrons (with the exception of a glucose transporter along the proximal tubule and the H+-pump along the collecting duct), the model yields segmental deliveries and urinary excretion of volume and key solutes that are consistent with human data. The model predicted that the human nephron exhibits glomerulotubular balance, such that proximal tubular Na+ reabsorption varies proportionally to the single-nephron glomerular filtration rate. To simulate the action of a novel diabetic treatment, we inhibited the Na+-glucose cotransporter 2 (SGLT2) along the proximal convoluted tubule. Simulation results predicted that the segment's Na+ reabsorption decreased significantly, resulting in natriuresis and osmotic diuresis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,512
Score d'incertitude au seuil0,413

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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