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Enregistrement W2917063005 · doi:10.14785/lymphosign-2019-0001

Coronin 1A deficiency identified by newborn screening for severe combined immunodeficiency

2019· article· en· W2917063005 sur OpenAlexaffvenue
Yael Dinur Schejter, Amarilla B. Mandola, Daniele Merico, Brenda Reid

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSevere combined immunodeficiencyImmunodeficiencyHypogammaglobulinemiaBiologyPrimary immunodeficiencySanger sequencingExome sequencingImmunologyMutationImmunodeficiency SyndromeImmune systemVirologyAntibodyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Coronin 1A belongs to a large family of actin regulatory proteins with a role in T cell homeostasis. A role for coronin 1A was also observed in macrophages, NK, and neuronal cells. To date, coronin 1A deficiency has been described in relatively few patients with combined immunodeficiency. Aim: We studied here the molecular and genetic basis of immunodeficiency detected by newborn screening for severe combined immunodeficiency. Methods: Patient data was collected in accordance with REB approved protocols. Immune work up, including T and B cell proliferative responses and serum concentrations of immunoglobulins, was performed. Next generation sequencing techniques and cellular analyses were also utilized. Results: The patient presented with T cell lymphopenia, reduction in CD4+CD45Ra+ cells and hypogammaglobulinemia. Uniquely, she also had persistent severe neutropenia. Whole exome sequencing and Sanger confirmation revealed a novel homozygous mutation in coronin 1A. Conclusion: Coronin 1A deficiency can be detected after birth by T cell receptor excision circle-based newborn screening. Statement of novelty: We report here a patient with a novel mutation in coronin 1A, identified during newborn screening with low T cell receptor excision circle levels and neutropenia, which is a unique finding in this condition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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