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Enregistrement W2917151158 · doi:10.1242/jeb.197640

3D ultrastructural organisation of calcium release units in the avian sarcoplasmic reticulum

2019· article· en· W2917151158 sur OpenAlexafffund
Thomas M. D. Sheard, Sanjay Kharche, Christian Pinali, Holly A. Shiels

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesCompute CanadaBritish Heart FoundationWellcome Trust
Mots-clésEndoplasmic reticulumMyocyteRyanodine receptorCalciumBiophysicsCoupling (piping)Calcium in biologyUltrastructureAnatomyContraction (grammar)IntracellularExcitation–contraction couplingCardiac muscleBiologyChemistryInternal medicineCell biologyEndocrinologyMedicineMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Excitation-contraction coupling in vertebrate hearts is underpinned by calcium (Ca2+) release from Ca2+ release units (CRUs). CRUs are formed by clusters of channels called ryanodine receptors on the sarcoplasmic reticulum (SR) within the cardiomyocyte. Distances between CRUs influence the diffusion of Ca2+, thus influencing the rate and strength of excitation-contraction coupling. Avian myocytes lack T-tubules, thus Ca2+ from surface CRUs (peripheral couplings, PCs), must diffuse to internal CRU sites of the corbular SR (cSR) during centripetal propagation. Despite this, avian hearts achieve higher contractile rates and develop greater contractile strength than many mammalian hearts, which have T-tubules to provide simultaneous activation of the Ca2+ signal through the myocyte. We used 3D electron tomography to test the hypothesis that the intracellular distribution of CRUs in the avian heart permits faster and stronger contractions despite the absence T-tubules. Nearest edge-edge distances between PCs and cSR, and geometric information including surface area and volumes of individual cSR, were obtained for each cardiac chamber of the White Leghorn chicken. Computational modelling was then used to establish a relationship between CRUs distances and cell activation time in the avian heart. Our data suggest that cSR clustered close together along the Z-line is vital for rapid propagation of the Ca2+ signal from the cell periphery to the cell centre which would aid in the strong and fast contractions of the avian heart.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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