Surveillance of laboratory exposures to human pathogens and toxins: Canada 2017
Notice bibliographique
Résumé
Background: Under Canada's Human Pathogens and Toxins Act and Human Pathogens and Toxins Regulations, the Public Health Agency of Canada (PHAC) is mandated with monitoring laboratory incident notifications through the Laboratory Incident Notification Canada (LINC) surveillance system.The year 2017 marks the second complete year of data.Objective: To describe the laboratory exposure and laboratory-acquired infection incidents that occurred in Canada in 2017 by sector, human pathogens and toxins involved, number of affected persons, incident type and root causes.Methods: The incidents included in the analysis occurred between January 1 and December 31, 2017.They were reported by laboratories with active licences to PHAC through the LINC surveillance system.Microsoft Excel 2010 was used for basic descriptive statistics.Results: A total of 44 exposure and laboratory-acquired infection incidents were reported to the LINC in 2017.Compared by sector and their respective shares of licences, the number of incidents was highest in the academic and hospital sectors compared with government laboratories and private industry.Altogether 118 people were exposed for an average of 2.7 people per incident (range of 1-29).There were no reports of secondary exposure.Six exposure incidents (14%) led to "suspected" (n=5) or confirmed (n=1) cases of laboratory-acquired infection.Although overall, risk group (RG)2 human pathogens and toxins were involved in the majority of incidents (n=23; 52%), Francisella tularensis (n=4; 9%) and Coccidioides immitis (n=3; 7%) were the most frequently involved in reported exposure incidents.These two pathogens are both RG3 and security-sensitive biological agents (SSBAs).An average of 2.3 root causes were identified per incident (n=101).Problems with standard operating procedures (SOPs) and human error were the two most common causes. Conclusion:The incidence of laboratory exposure incidents was relatively low in 2017.The most common route of exposure was through inhalation and the most common root causes were problems with SOPs and human error.Since this is a new surveillance system, baseline estimates are still being established.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».