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Enregistrement W2917788381 · doi:10.1097/ypg.0000000000000219

Understanding the schizophrenia phenotype in the first patient with the full SCN2A phenotypic spectrum

2019· article· en· W2917788381 sur OpenAlexaff
Jessica S. Suddaby, Josh Silver, Joyce So

Notice bibliographique

RevuePsychiatric Genetics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental HealthUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhenotypeExome sequencingAtaxiaGeneticsMutationSodium channelChannelopathySchizophrenia (object-oriented programming)MedicineProtein subunitBiologyGeneNeuroscienceChemistrySodiumPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The sodium voltage-gated channel α subunit 2 (SCN2A) gene encodes a subunit of sodium voltage-gated channels expressed primarily in the central nervous system that are responsible for action potential initiation and propagation in excitable cells. SCN2A mutations underlie a spectrum of distinct phenotypes, including seizure disorders, neurodevelopmental disorders, and rarer instances of episodic ataxia and schizophrenia. We report on a 38-year-old patient with adult-onset psychotic symptoms on a background of infantile-onset seizures, autistic features and episodic ataxia. Whole-exome sequencing revealed a de-novo novel SCN2A mutation (c.4966T > C, p.Ser1656Pro). This and other SCN2A mutations associated with the schizophrenia phenotype overlap those seen in neurodevelopmental disorders, suggesting a common underlying mechanism. This is the first report of a patient with the entire known SCN2A phenotypic spectrum. We highlight the importance of recognizing the psychiatric phenotypes associated with SCN2A mutations and that the phenotypic spectrum is more fluid, and less categorical, than previously thought.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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