Consequences of recombination for the evolution of the mating type locus in <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>
Notice bibliographique
Résumé
Summary Rationale Recombination suppression in sex chromosomes and mating type loci can lead to degeneration due to reduced selection efficacy and Muller’s ratchet effects. However, genetic exchange in the form of non-crossover gene conversions may still take place within crossover-suppressed regions. Recent work has found evidence that gene conversion may explain the low levels of allelic differentiation in the dimorphic mating type locus ( MT ) of the isogamous alga Chlamydomonas reinhardtii . However, no one has tested whether gene conversion is sufficient to avoid the degeneration of functional sequence within MT . Methods Here, we calculate levels of linkage disequilibrium (LD) across MT as a proxy for recombination rate and investigate its relationship to patterns of population genetic variation and the efficacy of selection in the region. Results We find that levels of LD predict selection efficacy across MT , and that purifying selection is stronger in shared genes than MT -limited genes to the point of being equivalent to that of autosomal genes. Conclusions We argue that isogamous systems without secondary sexual characteristics exhibit reduced selective pressure to differentiate sex chromosomes, and that recombination via gene conversion plays an important role in both reducing differentiation and preventing degeneration of crossover suppressed mating type loci.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».