Changes in phenylpropanoid pathway gene expression in roots and leaves of susceptible and resistant Brassica napus lines in response to Plasmodiophora brassicae inoculation
Notice bibliographique
Résumé
Clubroot, caused by the obligate parasite Plasmodiophora brassicae , is currently one of the most severe diseases of the Brassicaceae. As a soil-borne pathogen, P. brassicae infects the roots of host plants, inducing the formation of galls and negatively affecting plant growth and productivity. Roots and leaves of two clubroot susceptible and one resistant Brassica napus lines, inoculated with P. brassicae spores, were monitored for disease progression at four time points after inoculation. Quantitative gene expression analysis of phenylpropanoid pathway genes in these tissues showed increased expression of several genes involved in lignin biosynthesis in response to infection. In leaves, a higher expression of genes involved in flavonoid biosynthesis was also observed. In both roots and leaves of the resistant line, phenylpropanoid pathway genes were upregulated at more time points and at higher levels than in susceptible lines. The differential expression of phenylpropanoid pathway genes between resistant and susceptible lines, suggests that this pathway is instrumental in resistance to clubroot disease progression in the resistant line.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».