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Enregistrement W2918033089 · doi:10.3389/fgene.2019.00191

Big Data Needs Big Governance: Best Practices From Brain-CODE, the Ontario-Brain Institute’s Neuroinformatics Platform

2019· article· en· W2918033089 sur OpenAlexafffundabout
Shannon Lefaivre, Brendan Behan, Anthony L. Vaccarino, Kenneth Evans, Moyez Dharsee, Tom Gee, Costa Dafnas, Tom Mikkelsen, Elizabeth Theriault

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueScientific Computing and Data Management
Établissements canadiensIndoc ResearchOntario Brain Institute
Organismes subventionnairesGovernment of Ontario
Mots-clésNeuroinformaticsData sharingBig dataData scienceComputer scienceOpen dataOpen scienceBest practiceFlexibility (engineering)Data governanceScalabilityInteroperabilityData managementCorporate governanceField (mathematics)InformaticsWorld Wide WebPolitical scienceBusinessData miningDatabaseData qualityMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Ontario Brain Institute (OBI) has begun to catalyze scientific discovery in the field of neuroscience through its large-scale informatics platform, known as Brain-CODE. The platform supports the capture, storage, federation, sharing, and analysis of different data types across several brain disorders. Underlying the platform is a robust and scalable data governance structure which allows for the flexibility to advance scientific understanding, while protecting the privacy of research participants. Recognizing the value of an open science approach to enabling discovery, the governance structure was designed not only to support collaborative research programs, but also to support open science by making all data open and accessible in the future. OBI's rigorous approach to data sharing maintains the accessibility of research data for big discoveries without compromising privacy and security. Taking a Privacy by Design approach to both data sharing and development of the platform has allowed OBI to establish some best practices related to large-scale data sharing within Canada. The aim of this report is to highlight these best practices and develop a key open resource which may be referenced during the development of similar open science initiatives.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,100
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,117
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,744

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1000,117
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,010
Études des sciences et des technologies0,0100,020
Communication savante0,0260,019
Science ouverte0,0070,017
Intégrité de la recherche0,0050,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,254
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,104 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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