Targeted editing of the PSIP1 gene encoding LEDGF/p75 protects cells against HIV infection
Notice bibliographique
Résumé
To fulfill a productive infection cycle the human immunodeficiency virus (HIV) relies on host-cell factors. Interference with these co-factors holds great promise in protecting cells against HIV infection. LEDGF/p75, encoded by the PSIP1 gene, is used by the integrase (IN) protein in the pre-integration complex of HIV to bind host-cell chromatin facilitating proviral integration. LEDGF/p75 depletion results in defective HIV replication. However, as part of its cellular function LEDGF/p75 tethers cellular proteins to the host-cell genome. We used site-specific editing of the PSIP1 locus using CRISPR/Cas to target the aspartic acid residue in position 366 and mutated it to asparagine (D366N) to disrupt the interaction with HIV IN but retain LEDGF/p75 cellular function. The resulting cell lines demonstrated successful disruption of the LEDGF/p75 HIV-IN interface without affecting interaction with cellular binding partners. In line with LEDGF/p75 depleted cells, D366N cells did not support HIV replication, in part due to decreased integration efficiency. In addition, we confirm the remaining integrated provirus is more silent. Taken together, these results support the potential of site-directed CRISPR/Cas9 mediated knock-in to render cells more resistant to HIV infection and provides an additional strategy to protect patient-derived T-cells against HIV-1 infection as part of cell-based therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».