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Enregistrement W2918310131 · doi:10.1101/568717

Gut feelings begin in childhood: how the gut metagenome links to early environment, caregiving, and behavior

2019· preprint· en· W2918310131 sur OpenAlexaff
Jessica Flannery, Keaton Stagaman, Adam R. Burns, Roxana Hickey, Leslie E. Roos, Ryan J. Giuliano, Philip A. Fisher, Thomas J. Sharpton

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesUniversity of CambridgeAlfred P. Sloan FoundationNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésMicrobiomePsychosocialDevelopmental psychologyEarly childhoodStressorMetagenomicsGut microbiomePsychologySocioeconomic statusNormativeBiologyClinical psychologyMedicineEnvironmental healthPsychiatryGeneticsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Psychosocial environments impact normative behavioral development in children, increasing the risk of problem behaviors and psychiatric disorders across the lifespan. Converging evidence demonstrates early normative development is affected by the gut microbiome, which itself can be altered by early psychosocial environments. Nevertheless, these relationships are poorly understood in childhood, particularly beyond peri- and postnatal microbial colonization. To determine the gut microbiome’s role in the associations between childhood adversity and behavioral development, we conducted a metagenomic investigation among cross-sectional sample of early school-aged children with a range of adverse experiences and caregiver stressors and relationships. Our results indicate that the taxonomic and functional composition of the gut microbiome links to behavioral dysregulation during a critical period of child development. Furthermore, our analysis reveals that both socioeconomic risk exposure and child behaviors associate with the relative abundances of specific taxa (e.g., Bacteroides and Bifidobacterium species) as well as functional modules encoded in their genomes (e.g., monoamine metabolism) that have been linked to cognition and health. We also identified heretofore novel linkages between gut microbiota, their functions, and behavior. These findings hold important translational implications for developmental psychology and microbiome sciences alike, as they suggest that caregiver behavior might mitigate the impact of socioeconomic risk on the microbiome and modify the relationship between subclinical symptoms of behavioral dysregulation and the gut microbiome in early school-aged children.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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