Dependency of a validated radiomics signature on tumor volume and potential corrections
Notice bibliographique
Résumé
640 Purpose: Radiomics is foreseen as an essential prognostic tool for cancer risk assessment. The radiomics signature described in Aerts et al. (Nat. Commun. 2014) contains four features (1st order intensity, geometrical shape and higher order texture in image and in the wavelet domain): energy, compactness, grey-level non-uniformity (GLNU), and GLNU_HLH (GLNU in high-low-high subband). This signature was derived from pre-treatment CT scans of 422 lung cancer patients and subsequently tested in independent lung and head and neck (H&N) cancer cohorts (concordance-index of 0.65 in lung and 0.69 in both H&N cohorts). The authors claimed they had “shown for the first time the translational capability of radiomics in two cancer types” and that “radiomics quantifies a general prognostic cancer phenotype that likely can broadly be applied to other cancer types”. We investigated the dependency of the signature on tumour volume and suggest modifications to reduce it. Material and Methods: We extracted the features of the radiomics signature from both PET and CT components of PET/CT images of a multi-centric (4 different hospitals in Quebec) cohort of 300 H&N cancer patients. Absolute Spearman rank correlation (rs) was calculated between each of the four features and tumour volume. In order to reduce the observed dependency of the radiomic signature with tumour volume, we suggest alternative calculations for the shape and higher order features (see supplemental material). Results: Rs in PET (respectively CT) were 0.73 (resp. 0.71), 0.98 (resp. 0.94), 0.99 (resp. 0.98) and 0.89 (resp. 0.95) for energy, compactness, GLNU and GLNU_HLH respectively, showing great dependency of the radiomics signature on tumour volume. Using the revised calculations led to significantly lower rs values in PET (resp. CT) of 0.57 (resp. 0.50), 0.31 (resp. 0.15) and 0.11 (resp. 0.18) for compactness, GLNU and GLNU_HLH. Conclusions: Although the prognostic value of the radiomics signature was demonstrated in two cancer types in Aerts et al., we suggest that this translational capability of radiomics may have been primarily due to the fact that tumour volume is a strong prognostic factor in both cancer types. Indeed, according to the supplemental material of Aerts et al., concordance-index of volume alone was very close to that of the radiomics signature with 0.63 in lung and 0.68 and 0.65 in the two H&N cohorts. Further work is warranted to verify the translational capability of radiomics to different cancer types. Our first step will consist in evaluating the prognostic and translational value of the signature with revised calculations in both pathologies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».