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Enregistrement W2918486065

Implementation of genomic evaluation for digital dermatitis in Canada

2018· article· en· W2918486065 sur OpenAlexaffabout
Francecsa Malchiodi, J. Jamrozik, Anne-Marie Christen, G.J. Kistemaker, Pete Sullivan, Brian Van Doormaal, D.F. Kelton, Flávio S. Schenkel, F. Miglior

Notice bibliographique

RevueBulletin - International Bull Evaluation Service/Interbull bulletin · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal Behavior and Welfare Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHoofPopulationHeritabilityMedicineBiologyVeterinary medicineGeneticsEnvironmental healthAnatomy
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Digital dermatitis represents the most prevalent hoof lesion in Canada, with almost 20% of cows affected. A data collection system of hoof lesions, which uses standardized and reliable scores, was developed in Canada within a four-year project started in 2014. Hoof trimmers willing to share data and to develop a standard protocol were identified across Canada. Consecutively, a pipeline for a routine flow of hoof lesion records from hoof trimmers to Canadian DHI and to Canadian Dairy Network (CDN) was developed. The data collected through this pipeline were then used to develop a herd management report provided by DHI, and a national genomic evaluation for digital dermatitis offered by CDN. The genomic evaluation was introduced in December 2017, using hoof lesions recorded by hoof trimmers between 2006 and 2017. Heritability and repeatability estimates for digital dermatitis were 0.08 and 0.20, respectively. Breeding values were estimated for Holstein cattle with a univariate linear animal model. Other possible indicator traits for digital dermatitis, such as selected conformation traits, were not included due to low genetic correlations, and low contribution to increase in prediction reliability. Single-step genomic evaluation was implemented using a reference population of 19,459 animals (5,268 sires and 14,191 cows, respectively). The average reliability for bulls in the reference population was 77%. Correlations between GEBV for resistance to digital dermatitis and traits currently under selection were all favorable.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,381
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0450,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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