Implementation of genomic evaluation for digital dermatitis in Canada
Notice bibliographique
Résumé
Digital dermatitis represents the most prevalent hoof lesion in Canada, with almost 20% of cows affected. A data collection system of hoof lesions, which uses standardized and reliable scores, was developed in Canada within a four-year project started in 2014. Hoof trimmers willing to share data and to develop a standard protocol were identified across Canada. Consecutively, a pipeline for a routine flow of hoof lesion records from hoof trimmers to Canadian DHI and to Canadian Dairy Network (CDN) was developed. The data collected through this pipeline were then used to develop a herd management report provided by DHI, and a national genomic evaluation for digital dermatitis offered by CDN. The genomic evaluation was introduced in December 2017, using hoof lesions recorded by hoof trimmers between 2006 and 2017. Heritability and repeatability estimates for digital dermatitis were 0.08 and 0.20, respectively. Breeding values were estimated for Holstein cattle with a univariate linear animal model. Other possible indicator traits for digital dermatitis, such as selected conformation traits, were not included due to low genetic correlations, and low contribution to increase in prediction reliability. Single-step genomic evaluation was implemented using a reference population of 19,459 animals (5,268 sires and 14,191 cows, respectively). The average reliability for bulls in the reference population was 77%. Correlations between GEBV for resistance to digital dermatitis and traits currently under selection were all favorable.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».