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Enregistrement W2918507254 · doi:10.1101/566059

Functional arrays of human pluripotent stem cell-derived cardiac microtissues

2019· preprint· en· W2918507254 sur OpenAlexaff
Nimalan Thavandiran, Christopher M. Hale, Patrick H. Blit, Mark L. Sandberg, Michele McElvain, Mark Gagliardi, Bo Sun, Alec Witty, George Graham, May Mcintosh, Mohsen Afshar Bakooshli, Hon Le, Joel Östblom, Samuel McEwen, Erik Chau, Andrew B.J. Prowse, Ian Fernandes, Penney M. Gilbert, Gordon Keller, Philip Tagari, Xu Han, Milica Radisic, Peter W. Zandstra, Dana Nojima, Hugo M. Vargas, Yusheng Qu, Alykhan Motani, Jeff D. Reagan

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTissue Engineering and Regenerative Medicine
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreHeart and Stroke FoundationUniversity of British ColumbiaUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInduced pluripotent stem cellBiomedical engineeringTissue engineeringHuman Induced Pluripotent Stem CellsNanotechnologyCell mechanicsMaterials scienceComputer scienceCellChemistryEmbryonic stem cellEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT To accelerate the cardiac drug discovery pipeline, we set out to develop a platform that would be amenable to standard multiwell-plate manipulations and be capable of quantifying tissue-level functions such as contractile force. We report a 96-well-based array of 3D human pluripotent stem cell (hPSC)-derived cardiac microtissues - termed Cardiac MicroRings (CaMiRi) - in custom printed multiwell plates capable of contractile force measurement. Within each well, two elastomeric microcantilevers are situated above a ramp. The wells are seeded with cell-laden collagen which, in response to the slope of the ramp, self-organizes around tip-gated microcantilevers to form contracting CaMiRi. The contractile force exerted by the CaMiRi is measured and calculated using the deflection of the cantilevers. Platform responses were robust and comparable across wells and we used it to determine an optimal tissue formulation. We validated contractile force response of CaMiRi using selected cardiotropic compounds with known effects. Additionally, we developed automated protocols for CaMiRi seeding, image acquisition, and analysis to enable measurement of contractile force with increased throughput. The unique tissue fabrication properties of the platform, and the consequent effects on tissue function, were demonstrated upon adding hPSC-derived epicardial cells to the system. This platform represents an open-source contractile force screening system useful for drug screening and tissue engineering applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,093
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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