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Genome-wide association and transcriptome studies identify target genes and risk loci for breast cancer
Manuel A. R. Ferreira, Eric R. Gamazon, Fares Al‐Ejeh, Kristiina Aittomäki, Irene L. Andrulis, Hoda Anton‐Culver, Aðalgeir Arason, Volker Arndt, Kristan J. Aronson, Banu Arun, Ella Asseryanis, Jacopo Azzollini, Judith Balmañà, Daniel R. Barnes, Daniel Barrowdale, Matthias W. Beckmann, Sabine Behrens, Javier Benı́tez, Marina Bermisheva, Katarzyna Białkowska, Carl Blomqvist, Natalia Bogdanova, Stig E. Bojesen, Manjeet K. Bolla, Åke Borg, Hiltrud Brauch, Hermann Brenner, Annegien Broeks, Barbara Burwinkel, Trinidad Caldés, Maria A. Caligo, Daniele Campa, Ian Campbell, Federico Canzian, Jonathan Carter, Brian D. Carter, Jose E. Castelao, Jenny Chang‐Claude, Stephen J. Chanock, Hans Christiansen, Wendy K. Chung, Kathleen Claes, Christine L. Clarke, Julian Adlard, Munaza Ahmed, Julian Barwell, Angela Brady, Carole Brewer, Jackie Cook, Rosemarie Davidson, Alan C. Donaldson, Jacqueline Eason, Ros Eeles, D. Gareth Evans, Helen Gregory, Helen Hanson, Alex Henderson, Shirley Hodgson, Louise Izatt, Michael J. Kennedy, Fiona Lalloo, Clare Miller, Patrick J. Morrison, Kai‐Ren Ong, Jo Perkins, Mary Porteous, Mark T. Rogers, Lucy Side, Katie Snape, Lisa Walker, Patricia A. Harrington, Norbert Arnold, Bernd Auber, Nadja Bogdanova-Markov, Julika Borde, Almuth Caliebe, Nina Ditsch, Bernd Dworniczak, Stefanie Engert, Ulrike Faust, Andrea Gehrig, Eric Hahnen, Jan Hauke, Julia Hentschel, Ellen Honisch, Walter Just, Karin Kast, Mirjam Larsen, Johannes Lemke, Huu Phuc Nguyen, Dieter Niederacher, Claus‐Eric Ott, Konrad Platzer, Esther Pohl‐Rescigno, Juliane Ramser, Kerstin Rhiem, Doris Steinemann, Christian Sutter, Raymonda Varon-Mateeva, Shan Wang‐Gohrke, Bernhard H. F. Weber, Fabienne Prieur, Pascal Pujol, Charlotte Sagne, Nicolas Sévenet, Hagay Sobol, Johanna Sokolowska, Dominique Stoppa-Lyonnet, Laurence Venat-Bouvet, Fergus J. Couch, Angela Cox, Simon S. Cross, Kamila Czene, Mary B. Daly, Miguel de la Hoya, Joe Dennis, Peter Devilee, Orland Dı́ez, Thilo Dörk, Alison M. Dunning, Miriam Dwek, Bent Ejlertsen, Carolina Ellberg, Christoph Engel, Mikael Eriksson, Peter A. Fasching, Olivia Fletcher, Henrik Flyger, Eitan Friedman, Debra Frost, Marike Gabrielson, Manuela Gago-Domínguez, Patricia A. Ganz, Susan M. Gapstur, Judy E. Garber, Montserrat García‐Closas, José Á. García-Sáenz, Mia M. Gaudet, Graham G. Giles, Gord Glendon, Andrew K. Godwin, Mark S. Goldberg, David E. Goldgar, Anna González‐Neira, Mark H. Greene, Jacek Gronwald, Pascal Guénel, Christopher A. Haiman, Per Hall, U. Hamann, Wei He, Jane Heyworth, Antoinette Hollestelle, Robert N. Hoover, John L. Hopper, Peter J. Hulick, Keith Humphreys, Evgeny N. Imyanitov, Rosemary L. Balleine, Robert Baxter, Stephen Braye, Jane Carpenter, Jane E. Dahlstrom, John Forbes, Deborah J. Marsh, Adrienne Morey, Nirmala Pathmanathan, Peter Simpson, Allan D. Spigelman, Nicholas Wilcken, Desmond Yip, Bernadette A. M. Heemskerk‐Gerritsen, Matti A. Rookus, Caroline Seynaeve, Frederieke H. van der Baan, Annemieke H. van der Hout, Lizet E. van der Kolk, Rob B. van der Luijt, Carolien H. M. van Deurzen, Helena C. van Doorn, Klaartje van Engelen, Liselotte van Hest, Theo A.M. van Os, Senno Verhoef, Maartje J. Vogel, Juul Wijnen, Alexander Miron, Miroslav Kapuscinski, Anita Bane, Eric A. Ross, Saundra S. Buys, Thomas Conner, Claudine Isaacs, Milena Jakimovska, Anna Jakubowska, Paul A. James, Ramunas Janavicius, Rachel C. Jankowitz, Esther M. John, Nichola Johnson, Joseph Vijai, Beth Y. Karlan, Э. К. Хуснутдинова, Johanna I. Kiiski, Yon‐Dschun Ko, Michael E. Jones, Irene Konstantopoulou, Vessela N. Kristensen, Yael Laitman, Diether Lambrechts, Conxi Lázaro, Goska Leslie, Jenny Lester, Fabienne Lesueur, Sara Lindström, Jirong Long, Jennifer T. Loud, Jan Lubiński, Enes Makalic, Mehdi Manoochehri, Sara Margolin, Tabea Maurer, Dimitrios Mavroudis, Lesley McGuffog, Alfons Meindl, Usha Menon, Kyriaki Michailidou, Austin Miller, Marco Montagna, Fernando Moreno, Lidia Moserle, Anna Marie Mulligan, Katherine L. Nathanson, Susan L. Neuhausen, Heli Nevanlinna, Ines Nevelsteen, Finn C. Nielsen, Liene Ņikitina-Zaķe, Robert L. Nussbaum, Kenneth Offit, Edith Olah, Olufunmilayo I. Olopade, Håkan Olsson, Ana Osório, J. Papp, Tjoung-Won Park-Simon, Michael T. Parsons, Inge Søkilde Pedersen, Ana Peixoto, Paolo Peterlongo, Paul D.P. Pharoah, Dijana Plaseska-Karanfilska, Bruce Poppe, Nadège Presneau, Paolo Radice, Johanna Rantala, Gad Rennert, Harvey A. Risch, Emmanouil Saloustros, Kristin Sanden, Elinor J. Sawyer, Marjanka K. Schmidt, Rita K. Schmutzler, Priyanka Sharma, Xiao-Ou Shu, Jacques Simard, Christian F. Singer, Penny Soucy, Melissa C. Southey, John J. Spinelli, Amanda B. Spurdle, Jennifer Stone, Anthony J. Swerdlow, William Tapper, Jack A. Taylor, Manuel R. Teixeira, Mary Beth Terry, Àlex Teulé, Mads Thomassen, Kathrin Thöne, Darcy L. Thull, Marc Tischkowitz, Amanda E. Toland, Diana Torres, Thérèse Truong, Nadine Tung, Celine M. Vachon, Christi J. van Asperen, Ans M.W. van den Ouweland, Elizabeth J. van Rensburg, Ana Vega, Alessandra Viel, Qin Wang, Barbara Wappenschmidt, Jeffrey N. Weitzel, Camilla Wendt, Robert Winqvist, Xiaohong R. Yang, Drakoulis Yannoukakos, Argyrios Ziogas, Peter Kraft, Antonis C. Antoniou, Wei Zheng, Douglas F. Easton, Roger L. Milne, Georgia Chenevix‐Trench
Notice bibliographique
RevueNature Communications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversité LavalRoyal Victoria HospitalCentre hospitalier universitaire de QuébecMcGill UniversityUniversity Health NetworkUniversity of TorontoMcMaster UniversityJuravinski HospitalQueen's UniversityLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UK
Mots-clésTranscriptomeBreast cancerGenome-wide association studyGeneComputational biologyGeneticsGenomeBiologyCancerBioinformaticsSingle-nucleotide polymorphismGene expressionGenotype
Résumé
OpenAlex consigne un résumé pour ce travail, mais il n'a pas pu être récupéré à l'instant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,167
Score d'incertitude au seuil0,378
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations138
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui