MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2919136799 · doi:10.1161/res.123.suppl_1.414

Abstract 414: Transcriptome Analysis by RNA Sequencing of Left Ventricular Tissue From Mice Fed a High-Fat Diet

2018· article· en· W2919136799 sur OpenAlexaff
Stephen W. Luckey, Jesse D. Riordan, Courtney Olson, Joseph H. Nadeau

Notice bibliographique

RevueCirculation Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensStuart Olson (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscriptomeInternal medicineBiologyEndocrinologyMuscle hypertrophyObesityPathogenesisLeft ventricular hypertrophyGene expressionDiastoleFibrosisMedicineGeneBlood pressureBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A high-fat diet induces obesity and is associated with heart disease characterized by cardiac hypertrophy, diastolic dysfunction, fibrosis, and mitochondrial dysfunction. However, the molecular mechanisms involved in the pathogenesis of cardiac disease are not known. Therefore, the objective of this study was to investigate the molecular changes in the heart associated with a high-fat diet at early time points in the progression of cardiac disease. To do this, male C57BL/6 mice were fed either a chow diet or a high-fat (58 kcal%), low-sucrose (HFLS) diet starting at 5 weeks of age for 14 days and 100 days. At each time point, hearts were extracted and morphometric measurements were recorded. HFLS diet had no effect on weight gain at 14 days but did significantly increase body weight by two-fold at 100 days. At 14 days, there was no significant difference in cardiac size as measured by heart weight-to-tibia length ratio (HW/TL) between mice on HFLS diet and chow diet. However, there was a 24% increase in HW/TL following 100 days on the HFLS diet. Total RNA was extracted from left ventricular tissue from each group and gene expression was determined by RNA-Seq transcriptome analysis. DAVID functional pathway analysis of the top 50 genes with differential expression between diets at 14 days and 100 days identified significant enrichment for mitochondrial proteins and lipid metabolism at both time points on the HFLS diet. Moreover, there was enrichment for hypoxia response genes following 100 days on the HFLS diet. Analysis of genes with differential expression between 14 days and 100 days on HFLS diet identified enrichment for actin binding proteins/Z disc, glutathione transferase activity, and oxidation/reduction activity. These findings demonstrate significant differences in gene regulation in the hearts of mice fed a high fat diet at early time points. It is possible that these early molecular changes play a role in the progression of cardiac disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,558
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCirculation ResearchMême sujetAdipose Tissue and MetabolismTravaux en français237 207