Abstract 414: Transcriptome Analysis by RNA Sequencing of Left Ventricular Tissue From Mice Fed a High-Fat Diet
Notice bibliographique
Résumé
A high-fat diet induces obesity and is associated with heart disease characterized by cardiac hypertrophy, diastolic dysfunction, fibrosis, and mitochondrial dysfunction. However, the molecular mechanisms involved in the pathogenesis of cardiac disease are not known. Therefore, the objective of this study was to investigate the molecular changes in the heart associated with a high-fat diet at early time points in the progression of cardiac disease. To do this, male C57BL/6 mice were fed either a chow diet or a high-fat (58 kcal%), low-sucrose (HFLS) diet starting at 5 weeks of age for 14 days and 100 days. At each time point, hearts were extracted and morphometric measurements were recorded. HFLS diet had no effect on weight gain at 14 days but did significantly increase body weight by two-fold at 100 days. At 14 days, there was no significant difference in cardiac size as measured by heart weight-to-tibia length ratio (HW/TL) between mice on HFLS diet and chow diet. However, there was a 24% increase in HW/TL following 100 days on the HFLS diet. Total RNA was extracted from left ventricular tissue from each group and gene expression was determined by RNA-Seq transcriptome analysis. DAVID functional pathway analysis of the top 50 genes with differential expression between diets at 14 days and 100 days identified significant enrichment for mitochondrial proteins and lipid metabolism at both time points on the HFLS diet. Moreover, there was enrichment for hypoxia response genes following 100 days on the HFLS diet. Analysis of genes with differential expression between 14 days and 100 days on HFLS diet identified enrichment for actin binding proteins/Z disc, glutathione transferase activity, and oxidation/reduction activity. These findings demonstrate significant differences in gene regulation in the hearts of mice fed a high fat diet at early time points. It is possible that these early molecular changes play a role in the progression of cardiac disease.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».