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Enregistrement W2920106186 · doi:10.1039/c8dt04703k

G-Quadruplex binding optimization by gold(<scp>iii</scp>) insertion into the center of a porphyrin

2019· article· en· W2920106186 sur OpenAlexaff
Angélique Pipier, Aurore De Rache, Coralie Modeste, Samir Amrane, Emmanuelle Mothes-Martin, Jean‐Luc Stigliani, Patrick Calsou, Jean‐Louis Mergny, Geneviève Pratviel, Dennis Gómez

Notice bibliographique

RevueDalton Transactions · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensCanadian Nautical Research Society
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésPorphyrinStackingG-quadruplexPlanarCenter (category theory)ChemistryCrystallographySquare (algebra)Charge (physics)StereochemistryPhotochemistryPhysicsGeometryOrganic chemistryComputer scienceMathematicsDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Porphyrins represent a valuable class of ligands for G-quadruplex nucleic acids. Herein, we evaluate the binding of cationic porphyrins metallated with gold(iii) to G-quadruplex DNA and we compare it with other porphyrin derivatives. The G-quadruplex stabilization capacity and the selectivity of the various porphyrins were evaluated by biophysical and biochemical assays. The porphyrins were also tested as inhibitors of telomerase. It clearly appeared that the insertion of gold(iii) ion in the center of the porphyrin increases the binding affinity of the porphyrin for the G-quadruplex target. Together with modelling studies, it is possible to propose that the insertion of the square planar gold(iii) ion adds an extra positive charge on the complex and decreases the electron density in the porphyrin aromatic macrocycle, both properties being in favour of stronger electrostatic and π-staking interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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