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Enregistrement W2920217613 · doi:10.1038/s41598-019-40151-2

Comparing the effects of non-homogenous mixing patterns on epidemiological outcomes in equine populations: A mathematical modelling study

2019· article· en· W2920217613 sur OpenAlexafffund
Rachael M. Milwid, Terri L. O’Sullivan, Zvonimir Poljak, Marek Laskowski, Amy L. Greer

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensYork UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Food and AgricultureCanada Research Chairs
Mots-clésIncidence (geometry)Mixing (physics)Mixing patternsTransmission (telecommunications)Epidemic modelCumulative incidenceStatisticsEpidemiologyDemographyMathematicsBiologyComputer scienceMedicinePopulationTelecommunicationsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Disease transmission models often assume homogenous mixing. This assumption, however, has the potential to misrepresent the disease dynamics for populations in which contact patterns are non-random. A disease transmission model with an SEIR structure was used to compare the effect of weighted and unweighted empirical equine contact networks to weighted and unweighted theoretical networks generated using random mixing. Equine influenza was used as a case study. Incidence curves generated with the unweighted empirical networks were similar in epidemic duration (5-8 days) and peak incidence (30.8-46.4%). In contrast, the weighted empirical networks resulted in a more pronounced difference between the networks in terms of the epidemic duration (8-15 days) and the peak incidence (5-25%). The incidence curves for the empirical networks were bimodal, while the incidence curves for the theoretical networks were unimodal. The incorporation of vaccination and isolation in the model caused a decrease in the cumulative incidence for each network, however, this effect was only seen at high levels of vaccination and isolation for the complete network. This study highlights the importance of using empirical networks to describe contact patterns within populations that are unlikely to exhibit random mixing such as equine populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,287
Tête enseignante GPT0,429
Écart entre enseignants0,142 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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