Comparing the effects of non-homogenous mixing patterns on epidemiological outcomes in equine populations: A mathematical modelling study
Notice bibliographique
Résumé
Disease transmission models often assume homogenous mixing. This assumption, however, has the potential to misrepresent the disease dynamics for populations in which contact patterns are non-random. A disease transmission model with an SEIR structure was used to compare the effect of weighted and unweighted empirical equine contact networks to weighted and unweighted theoretical networks generated using random mixing. Equine influenza was used as a case study. Incidence curves generated with the unweighted empirical networks were similar in epidemic duration (5-8 days) and peak incidence (30.8-46.4%). In contrast, the weighted empirical networks resulted in a more pronounced difference between the networks in terms of the epidemic duration (8-15 days) and the peak incidence (5-25%). The incidence curves for the empirical networks were bimodal, while the incidence curves for the theoretical networks were unimodal. The incorporation of vaccination and isolation in the model caused a decrease in the cumulative incidence for each network, however, this effect was only seen at high levels of vaccination and isolation for the complete network. This study highlights the importance of using empirical networks to describe contact patterns within populations that are unlikely to exhibit random mixing such as equine populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,024 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».