Potential of the Burkholderia cepacia Complex to Produce 4-Hydroxy-3-Methyl-2-Alkyquinolines
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
A few Burkholderia species, especially Burkholderia pseudomallei, Burkholderia thailandensis, Burkholderia ambifaria and Burkholderia cepacia, are known to produce and release various 4-hydroxy-3-methyl-2-alkylquinolines (HMAQs), a family of molecules analogous to the 4-hydroxy-2-alkylquinolines (aka 2-n-alkyl-4(1H)-quinolones) of Pseudomonas aeruginosa, which include the Pseudomonas quinolone signal (PQS). However, while these exoproducts play several roles in P. aeruginosa virulence and survival, the available literature is very limited on their distribution and function in Burkholderia. Here, we studied the distribution of the hmqABCDEFG operon, which encodes the enzymes involved in the biosynthesis of HMAQ, in the Burkholderia cepacia complex (Bcc) group. Based on the available sequence data, about one third of Bcc species carry a homolog of the hmqABCDEFG, and not all sequenced strains in a given species possess this operon. Looking at the synteny of genes surrounding the hmqABCDEFG operon, we found that for some species, the operon seems to have been deleted or replaced by other genes. Finally, we review the literature on the possible function of HMAQs. Understanding the Hmq system may provide clues concerning their functions in Bcc
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle