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Enregistrement W2920794653 · doi:10.71781/30741

Rôle des modulateurs de la protéine kinase D dans la propagation du virus herpès simplex de type 1

2018· dissertation· fr· W2920794653 sur OpenAlexfundno aff
Élisabeth Roussel

Notice bibliographique

RevuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2018
Typedissertation
Languefr
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de Montréal
Mots-clésMolecular biologyVirologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Le virus herpès simplex de type 1 affecte la population mondiale en entraînant des lésions bénignes comme les feux sauvages, mais aussi des complications sévères telles que la cécité. Les traitements actuels ne permettent toutefois pas d’éradiquer ce virus, car ce dernier a notamment un rapide et complexe cycle de vie. Les acteurs moléculaires impliqués dans les différentes étapes du cycle viral sont encore peu connus, mais le laboratoire a précédemment démontré l’implication de la protéine kinase D de l’hôte et du diacylglycérol, sa principale molécule d’ancrage, dans la sortie du virus du réseau trans-Golgien vers la membrane plasmique. Ce projet de maîtrise va plus loin en étudiant le rôle des différents modulateurs de la protéine kinase D dans la propagation virale. Suite à des expériences d’ARN d’interférence, de surexpression et l’utilisation de drogue, les résultats démontrent que, contrairement à la protéine kinase D, plusieurs de ses modulateurs comme CERT, GGA1 et Nir2 régulent négativement la relâche extracellulaire du virus. Ces effets seraient d’ailleurs indépendants des niveaux intracellulaires totaux de diacylglycérol. La microscopie électronique suggère enfin que la protéine kinase D et Nir2 ne jouent pas seulement un rôle au niveau du réseau trans-Golgien, mais affectent également d’autres étapes de la propagation virale comme la sortie nucléaire. Au final, ces résultats contribuent à une meilleure compréhension du transport du virus herpès simplex de type 1 et de ses interactions avec la cellule hôte. Ces nouvelles données pourraient éventuellement mener au développement de nouveaux traitements, puisqu’elles peuvent s’appliquer à d’autres virus ou aux larges cargos cellulaires.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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