Predictors of germline DNA damage repair gene mutations (gDDRm) in patients (pts) with metastatic castration-resistant prostate cancer (CRPC).
Notice bibliographique
Résumé
159 Background: gDDRm are present in 6-12% of pts with CRPC and have implications for prognosis, treatment outcomes and familial screening. This study's aim was to identify clinical/pathologic characteristics associated with a higher risk of a pt harboring a gDDRm. Methods: 631 consecutive pts with metastatic prostate cancer were screened for germline mutations in 22 DNA repair genes (including ATM, BRCA1/2, MSH2/6, FANC/ERCC members). Clinical/pathologic characteristics (age at diagnosis, visceral metastases (mets) at time of CRPC, Gleason score, intraductal/cribriform histology (I/C) at diagnosis, family history (FHx) of prostate, breast, ovarian, or pancreatic cancer, time from androgen deprivation therapy initiation to CRPC) were compared between gDDRm+ and gDDRm- cases. A multivariate logistic model of gDDRm status was constructed using purposeful selection of covariates where clinical judgement was employed in addition to statistical significance. A weighted scoring system was created by multiplying each risk factor (RF) by its estimated β coefficient. A pt’s total score was calculated by the sum of each weighted RF. Results: gDDRm+ were identified in 38/631 pts (6.0%, BRCA2 = 28, ATM = 4, BRCA1 = 2, PALB2 = 2, MSH2 = 1, ERCC3 = 1). 29 gDDRm+ and 128 gDDRm- cases with complete clinical/pathologic information were included in the model. Multivariate modeling revealed that visceral mets, FHx and I/C were statistically significantly associated with gDDRm+; age ≤ 65 was included in the model because it was considered clinically relevant (Table). Based on the model results, the weights of each RF are: visceral mets (2), FHx (1), I/C (2), age ≤ 65 (1). Using a total score cut-off ≥ 1, the model achieves a sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value of 97%, 31%, 24%, and 98%, respectively. Conclusions: In this cohort, visceral mets, FHx and I/C were independently associated with a higher risk of harboring a gDDRm. The predictive model may aid in selecting pts for gDDRm screening. Model validation is required. [Table: see text]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».