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Enregistrement W2920852356 · doi:10.1093/jcag/gwz006.251

A252 THE DIETARY FIBRE, RHAMNOGALACTURONAN (RGAL), DRIVES AN INFLAMMATORY GENE EXPRESSION PROFILE IN INTESTINAL EPITHELIAL CELLS

2019· article· en· W2920852356 sur OpenAlexaffabout
Jinsai Shang, Cristiane Hatsuko Baggio, Antonia Maiara Marques do Nascimento, Thales R. Cipriani, Wallace K. MacNaughton

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInflammationTranscriptomeInflammatory bowel diseaseWound healingEpitheliumImmunologyIntestinal epitheliumBiologyCell biologyIntestinal mucosaCaco-2Barrier functionGene expressionCellPathologyMedicineGeneInternal medicineDiseaseBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Impaired mucosal healing in the intestinal epithelium has been linked to inflammatory bowel disease (IBD). While the resolution of inflammation was historically perceived to be a passive process of mucosal healing, we have begun to appreciate that cells and mediators that have traditionally been considered pro-inflammatory, are also crucial in the resolution of inflammation. Specifically, recent evidence suggests that neutrophils, while important contributors to acute inflammation, are also key elements in the pro-resolution microenvironment that promotes mucosal healing in the inflamed gut. Our previous data have shown that administration of the dietary fibre, rhamnogalacturonan (RGal), reduces disease severity in a murine model of DSS colitis. Additionally, apical treatment of the Caco-2 human intestinal epithelial cell line with RGal induces an increase in transepithelial electrical resistance (TER) and accelerates wound-healing in vitro. We hypothesized that RGal promotes a healing response in epithelial cells via the production of mediators that contribute to the establishment of a pro-resolution microenvironment. The aims of this project are to (1) Characterize the receptor(s) and signalling pathways activated by RGal in intestinal epithelial cells and (2) determine the ability of RGal to create a pro-resolution inflammatory milieu and mediate neutrophil-epithelial interactions. In order to determine the transcriptionally dependent effects of RGal on epithelial function, Caco-2 monolayers were treated apically for 6, 12 and 24h with RGal, and RNA collected for transcriptome sequencing. Genes with changes in expression more than 3-fold were entered into Enrichr for pathway analysis. In order to confirm changes in protein expression from transcriptome sequencing data, Meso Scale Discovery (MSD) multi-array immunoassay was performed. RGal differentially induced changes in gene expression 6, 12 and 24h post-treatment. While RGal had no significant effect on tight junction gene expression 6h post-treatment, RGal upregulated the expression of inflammatory response genes including neutrophil regulatory genes (CXCL1, 243.9-fold; CXCL2, 15.2-fold; CXCL3, 58.8-fold; CXCL5, 57-fold; CXCL8, 515.6-fold; G-CSF, 18-fold; n=3; p<0.05). Consistent with gene expression data, MSD multi-plex immunoassay revealed an upregulation in CXCL8 family chemokines. For example, CXCL8 production was increased in cell lysates 116.1-fold 2h post-treatment (n=3; p<0.01) and secretion of CXCL8 was increased 11.8-fold in cell supernatants 8h post-treatment (n=3; p<0.05). RGal drives the expression of neutrophil regulatory genes in intestinal epithelial cells. Thus, RGal may contribute a pro-resolution inflammatory milieu by facilitating neutrophil-epithelial interactions. Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC); The American Physiological Society (APS)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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