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Enregistrement W2920864696 · doi:10.3389/fmicb.2019.00456

Selection of Multidrug-Resistant Bacteria in Medicated Animal Feeds

2019· article· en· W2920864696 sur OpenAlexaff
Emily E. F. Brown, Ashley Cooper, Catherine D. Carrillo, Burton W. Blais

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePharmaceutical and Antibiotic Environmental Impacts
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntibioticsBacteriaBiologyMultiple drug resistanceAntimicrobialMicrobiologyAntibiotic resistanceSulfadiazineDrug resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Exposure to antimicrobial resistant (AMR) bacteria is a major public health issue which may, in part, have roots in food production practices that are conducive to the selection of AMR bacteria ultimately impacting the human microbiome through food consumption. Of particular concern is the prophylactic use of antibiotics in animal husbandry, such as the medication of feeds with sulfonamides and other antibiotics not considered clinically relevant, but which may nonetheless co-select for multi-drug resistant bacteria harbouring resistance to medically-important antibiotics. Using a multi-drug resistant Klebsiella pneumoniae strain exhibiting resistance to sulfonamides and beta-lactams (including carbapenem) as a model, we examined the ability of non-medicated and commercially-medicated (sulfonamide) animal feeds to select for the model strain when inoculated at low levels by measuring its recovery along with key AMR markers, sul1(sulfonamide) and blaKPC-3 (meropenem), under different incubation conditions. When non-medicated feeds were supplemented with defined amounts of sulfadiazine the model strain was significantly enriched after incubation in Mueller Hinton Broth at 37oC overnight, or in same at room temperature for a week, with consistent detection of both the sul1 and blaKPC-3 markers as determined by polymerase chain reaction (PCR) techniques to screen colony isolates recovered on plating media. Significant recoveries of the inoculated strain and the sul1 and blaKPC-3 markers were observed with one of three commercially-medicated (sulfamethazine) feeds tested under various incubation conditions. These results demonstrate that under certain conditions the prophylactic use of so-called non-priority antibiotics in feeds can potentially lead to co-selection of environmental AMR bacteria with resistance to medically important antibiotics, which may have far-reaching implications for human health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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