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Enregistrement W2920935249 · doi:10.12688/gatesopenres.12912.2

Highly Efficient Clinical Trials Simulator (HECT): Software application for planning and simulating platform adaptive trials

2019· preprint· en· W2920935249 sur OpenAlexaff
Kristian Thorlund, Shirin Golchi, Jonas Häggström, Edward J. Mills

Notice bibliographique

RevueGates Open Research · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésComputer scienceSimulationSoftwareClinical trialMedicineOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Adaptive designs and platform designs are among two common clinical trial innovations that are increasingly being used to manage medical intervention portfolios and attain faster regulatory approvals. Planning of adaptive and platform trials necessitate simulations to understand how a set of adaptation rules will likely affect the properties of the trial. Clinical trial simulations, however, remain a black box to many clinical trials researchers who are not statisticians. Results: In this article we introduce a simple intuitive open-source browser-based clinical trial simulator for planning adaptive and platform trials. The software application is implemented in RShiny and features a graphical user interface that allows the user to set key clinical trial parameters and explore multiple scenarios such as varying treatment effects, control response and adherence, as well as number of interim looks and adaptation rules. The software provides simulation options for a number of designs such as dropping treatment arms for futility, adding a new treatment arm (i.e., platform design), and stopping a trial early based on superiority. All available adaptations are based on underlying Bayesian probabilities. The software comes with a number of graphical outputs to examine properties of individual simulated trials. The main output is a comparison of trial design performance across several simulations, graphically summarizing type I error (false positive risk), power, and expected cost/time to completion of the considered designs. Conclusion: We have developed and validated an intuitive highly efficient clinical trial simulator for planning of clinical trials. The software is open-source and caters to clinical trial investigators who do not have the statistical capacity for trial simulations available in their team. The software can be accessed via any web browser via the following link: https://mtek.shinyapps.io/hect/

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,044
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,229

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,044
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0680,015

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,939
Tête enseignante GPT0,746
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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