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Enregistrement W2921075952 · doi:10.1093/jcag/gwz006.155

A156 SIALIC ACID UTILIZATION IS ESSENTIAL FOR THE IN VIVO METABOLIC FITNESS OF THE ENTERIC BACTERIAL PATHOGEN CITROBACTER REDENTIUM

2019· article· en· W2921075952 sur OpenAlexaff
Qiuli Liang, H Yu, Bruce A. Vallance

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCitrobacter rodentiumMicrobiologySialic acidBiologyPathogenVirulenceIn vivoBiochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The intestinal pathogens enteropathogenic and enterohemorrhagic E. coli (EPEC/EHEC) pose a significant threat to human health worldwide. These pathogens colonize host intestinal mucosal surface, forming attaching/effacing (A/E) lesions, and causing severe diarrheal disease. Currently it is unclear how resident commensals and nutritional sources in the gut influence these A/E pathogens during the course of infection. However, based on their location at the mucosal surface, they must closely interact with the intestinal mucus, which is largely composed of the highly glycosylated protein Muc2. As the most common terminal sugar on Muc2 glycans, sialic acid is actively cleaved by commensal microbes expressing sialidases, providing nutrition for themselves, as well as nearby bacteria. Recent studies suggest that host-derived sialic acid is important for the fitness of many intestinal pathogens. Citrobacter rodentium – a mouse A/E pathogen, contains genes necessary for transport and catabolism of sialic acid, however whether sialic acid plays a role in in vivo metabolism of A/E pathogens and their virulence remains unclear. To examine the role of sialic acid utilization in C. rodentium pathogenesis. A sialic acid transporter mutant of C. rodentium (ΔnanT) was constructed and tested in in vitro growth assays and in vivo infection, in comparison with wildtype (WT) C. rodentium. C57Bl/6 mice were infected with either WT or ΔnanT C. rodentium by oral gavage and monitored daily until euthanized at day 8 post infection (PI). In some infections, mice were pretreated with 20 mg streptomycin, 24 h before infection. In vitro growth assays showed that although WT C. rodentium was able to utilize sialic acid as a sole carbon source for growth, ΔnanT was unable to do so. Moreover, ΔnanT was significantly impaired in its ability to colonize the intestines of mice, being found at very low numbers in tissues and colonic lumen (102–103 CFU/g) at day 8 PI. In contrast, WT C. rodentium underwent rapid expansion in the colonic environment. Correspondingly, minimal histopathological damage was observed in ΔnanT infected mice. Interestingly, when mice were depleted of commensals by streptomycin, ΔnanT is able to readily colonize the intestines at comparable levels with the WT strain in terms of pathogen burdens, localization and pathology scores, suggesting the streptomycin freed up additional nutrients for ΔnanT. These results demonstrate that C. rodentium employs the nan transporter system for sialic acid utilization, which is essential for establishing its colonization in the mouse intestine. Moreover, these findings suggest that commensal microbes play a key role in controlling the availability of sialic acid in the colonic environment, thereby affecting the virulence and metabolism of A/E bacterial pathogens. CAG, CCC, CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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