MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2921127015 · doi:10.1136/bmjgast-2018-000241

<i>PNPLA3</i> gene predicts clinical recovery after sustained virological response in decompensated hepatitis C cirrhosis

2019· article· en· W2921127015 sur OpenAlexfundno aff
Winston Dunn, Anusha Vittal, Jie Zhao, Jianghua He, Shweta Chakraborty, Melissa Whitener, Sara Fohn, Ryan Ash, Ryan M. Taylor, Mojtaba Olyaee, Jody C. Olson, Nancy Todd, Beth Floyd, Prashant Pandya, Melissa Laycock, Timothy M. Schmitt, Steven A. Weinman

Notice bibliographique

RevueBMJ Open Gastroenterology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institutes of HealthNational Center for Research ResourcesValeant Pharmaceuticals InternationalNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesGilead SciencesBristol-Myers Squibb
Mots-clésMedicineCirrhosisInternal medicineHepatitis CGastroenterologyVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Patients with decompensated hepatitis C virus (HCV) cirrhosis experience various outcomes after sustained virological response (SVR), ranging from clinical recovery to further deterioration. We hypothesised that the genetic risk for steatosis, namely the polymorphisms rs738409 of Patatin-like Phospholipase Domain-Containing 3 (PNPLA3), rs58542926 of Transmembrane-6-Superfamily-2 (TM6SF2), and rs641738 of Membrane-bound O-acyltransferase Domain-Containing 7 (MBOAT7), is predictive of recovery. Methods We prospectively enrolled 56 patients with Child-Pugh (CPT) B/C cirrhosis who underwent antiviral therapy. The primary outcome was change in CPT score at 12, 24, and 48 weeks after SVR. We used a linear mixed-effects model for analysis. Results Forty-five patients (PNPLA3: 21 CC, 19 CG, 5 GG) survived to the first endpoint without liver transplantation. The mean change in CPT score at 12, 24, and 48 weeks was −1.57 (SE=0.30), –1.76 (SE=0.32), and −2.0 (SE=0.36), respectively, among the patients with the PNPLA3 CC genotype and −0.50 (SE=0.20), –0.41 (SE=0.25), and −0.24 (SE=0.27), respectively, among the other 24 patients. After adjustment for baseline characteristics, the PNPLA3 CG/GG genotypes were associated with a 1.29 (SE=0.30, p<0.0001) point higher CPT score. Most of the difference came from differences in hepatic encephalopathy and bilirubin. The results for rs58542926 and rs641738 were not significant. Conclusion The PNPLA3 CG/GG genotypes could identify a subgroup of patients with decompensated HCV cirrhosis that had suboptimal clinical recovery despite SVR. An understanding of the genetic factors that influence clinical outcomes will help target patients for liver transplant based on individual genetic risk factors and provide insight leading to new therapeutic approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,401
Écart entre enseignants0,353 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMJ Open GastroenterologyMême sujetHepatitis C virus researchTravaux en français237 207