MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2921151092 · doi:10.1200/jco.2019.37.7_suppl.280

Abi1 loss drives prostate tumorigenesis through activation of EMT and noncanonical WNT signaling.

2019· article· en· W2921151092 sur OpenAlexaff
Disharee Nath, Xiang Li, Claudia Mondragon, Dawn E. Post, Ming Chen, Anita Hryniewicz‐Jankowska, Tiffany Caza, Julie R. White, Vladimir A. Kuznetsov, Heidi Hehnly, Rakesh Khanna, Stephanie Gleicher, Tamara Jamaspishvili, David M. Berman, Fan Zhang, Sonia H.Y. Kung, Ladan Fazli, Gennady Bratslavsky, Pier Paolo Pandolfi, Leszek Kotula

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayCancer researchProstate cancerCarcinogenesisBiologyCancerSignal transductionCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

280 Background: Prostate cancer is characterized by heterogeneity of mechanisms which are poorly understood but pointing to epithelial plasticity as the key mechanism in progression to metastatic disease. ABI1, a member of WAVE complex and actin cytoskeleton regulator and adaptor protein, is proposed to act as tumor suppressor in prostate cancer, but the mechanism of tumor progression due to Abi1 loss is not clear. Methods: To address Abi1’s role in prostate cancer we used CRISPR-based gene editing and retroviral expression to manipulate Abi1 levels in prostate cancer cell lines. Levels of Abi1 expression in prostate organoid tumor cell lines were evaluated by Western blotting and/or RNA sequencing. Association of Abi1 loss with tumor grade was evaluated by immunohistochemistry. Results: Abi1 expression is downregulated in tumor organoid cell lines from metastatic bone and lymph node biopsies. Moreover, low Abi1 expression is associated with high-grade prostate tumors (GG3 or higher, p < 0.001). Disruption of Abi1 gene in a benign prostate epithelial cell line RWPE-1 resulted in a gain of invasive phenotype, which is characterized by loss of cell-cell adhesion markers and increased migratory ability of RWPE-1 Abi1 KO spheroids. Through RNA sequencing and protein expression analysis we discovered that Abi1 loss leads to activation of non-canonical WNT signaling and EMT pathways, which are rescued by re-expression of Abi1. Furthermore, increase in STAT3 phosphorylation upon Abi1 inactivation and evidence for high affinity interaction of FYN-SH2 domain with Abi1 pY421 support the model that Abi1 acts as a gatekeeper of the non-canonical WNT-EMT pathway activation downstream from FZD2 receptor. The gene expression profile of Abi1-EMT-WNT pathway overlaps with the reported gene signature of high-risk prostate tumors. Conclusions: Abi1 contributes to prostate cancer progression and epithelial plasticity through regulation of EMT-WNT pathways. Understanding of Abi1’s role may provide more mechanistic understanding of prostate cancer tumor progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,483
Écart entre enseignants0,377 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical Oncology→Même sujetProstate Cancer Treatment and Research→Travaux en français237 207→