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Enregistrement W2921153734 · doi:10.1093/jcag/gwz006.009

A10 DEFINING A ROLE FOR GOBLET CELL MUCUS-ASSOCIATED PROTEINS IN INNATE HOST DEFENSE

2019· article· en· W2921153734 sur OpenAlexaff
Hayley Gorman, France Moreau, Kris Chadee

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMucinMucin 2MucusBiologyCell biologyGoblet cellInnate immune systemImmunologyEpitheliumGene expressionBiochemistryGeneGeneticsImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MUC2 mucin secreted by goblet cells is first line of innate host defense separating the single layer of epithelial cells that lines the gut. Mucus serves as a substrate and food source for bacteria and creates a viscous physical barrier between the lumen and the underlying epithelial cells. Even though MUC2 mucin is important in health and disease, there are numerous other mucus-associated proteins (MAPs) that are uncharacterized includingcalcium-activated chloride channel regulator 1 (CLCA1), Fcfragment of IgG binding protein (FCGBP) and kallikrein 1 (KLK1). The functions of these MAPs are not known but are believed to stabilized MUC2 and/or aid in their protective functions. The goal of this study is to functionally characterize MAPs to define their role in mucosal homeostasis and host defense. Hypothesis: MUC2 mucin and MAPs play important roles in innate host defense. The specific aims are: 1. To determine if MUC2 mucin regulates the expression and production of MAPs 2. To quantify a role for MAPs in colitis To determine if high MUC2 mucin production regulates the expression of MAPs, human HT29/LS174T goblet and CRISPR/Cas9 MUC2 KO cells were used. QPCR and Western blotting were used to determine changes at the mRNA and protein level, respectively. HT29 WT and CRISPR/Cas9 MUC2 KO cells were mechanically wounded in vitroto model epithelial injury. Muc2+/+and Muc2-/-littermates were used to basally characterize the expression of MAPs and in response to DSS-induced colitis. The temporal expression ofMUC2, FCGBP, CLCA1and KLK1in WT and CRISPR/Cas9 HT29/LS174T MUC2 KO cells peaked at day 5 and remained high up to day 9. Similar basal mRNA expressions were noted from healthy human colonic biopsy specimens that were significantly decreased in active UC but restored to basal levels in UC in remission. In wounded HT29 CRISPR/Cas9 MUC2 KO cells as early as day 2, FCGBP, CLCA1 andKLK1were upregulated as compared to WT cells. In Muc2+/+and Muc2-/-littermates and organoids derived from Muc2+/+and Muc2-/-colons, MAPs were basally expressed at similar levels. However in DSS colitis, MAPs mRNA transcripts and protein levels significantly decreased steadily up to day 15 in Muc2+/+but not Muc2-/-littermates. At the height of colitis (days 8–12) Clca1expression disappeared and Fcgbp, Clca1 and Klk1were not restored during restitution (day 15). This study demonstrates that the presence of MUC2 mucin and MAPs are not mucus-associated or developmentally regulated but highly susceptible to DSS colitis and active UC. CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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