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Enregistrement W2921155986 · doi:10.1200/jco.2019.37.7_suppl.42

Identifying molecular determinants of response to apalutamide (APA) in patients (pts) with nonmetastatic castration-resistant prostate cancer (nmCRPC) in the SPARTAN trial.

2019· article· en· W2921155986 sur OpenAlexaff
Felix Y. Feng, Shibu Thomas, Michael Gormley, Angela Lopez‐Gitlitz, Margaret K. Yu, Shinta Cheng, Deborah Ricci, Oliver Brendan Rooney, Paul N. Mainwaring, David Olmos, Fred Saad, Simon Chowdhury, Boris Hadaschik, Nicholas Fishbane, Elai Davicioni, Yang Liu, Eric J. Small, Matthew R. Smith

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineDECIPHERProstate cancerSubtypingOncologyAndrogen deprivation therapyInternal medicineHazard ratioTranscriptomeCancerBioinformaticsGeneBiologyConfidence intervalGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

42 Background: The SPARTAN trial recently demonstrated that addition of APA to androgen deprivation therapy (ADT) improved metastasis-free survival (MFS) and second progression-free survival (PFS2) in nmCRPC pts. We performed transcriptome-wide profiling of available primary tumor samples from pts in SPARTAN to evaluate potential biomarkers of response or resistance to APA+ADT. Methods: Pts included in SPARTAN were at high risk of developing metastasis.We used a commercially available genomic assay (DECIPHER prostate test, GenomeDx Biosciences, Inc., San Diego, CA) to assess gene expression in 233 archived primary tumors from SPARTAN pts. Using a Cox proportional hazard model, we assessed the association between scores and subtypes from previously derived prognostic and predictive gene signatures, such as DECIPHER and basal (BA) vs luminal (LU) subtyping. Results: Pts with high DECIPHER scores had greater treatment effect with APA+ADT than those with low scores. Pts with LU, a subtype known to be sensitive to ADT, greatly benefited from APA+ADT. Pts with BA, typically resistant to ADT, also benefited from APA+ADT. Conclusions: DECIPHER score and BA or LU subtype may be biomarkers of response to APA+ADT. DECIPHER may be useful for identifying pts for early treatment intensification with APA or other agents, and molecular subtyping may be an effective approach for pt selection in trials combining novel therapies with APA. Clinical trial information: NCT01946204. [Table: see text]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,120
Tête enseignante GPT0,497
Écart entre enseignants0,377 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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