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Enregistrement W2921395718 · doi:10.1101/580076

Adenovirus serotype 26 utilises sialic acid bearing glycans as a primary cell entry receptor

2019· preprint· en· W2921395718 sur OpenAlexaff
Alexander T. Baker, Rosie M. Mundy, James A. Davies, P.J. Rizkallah, Alan L. Parker

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesTenovusHigher Education Funding Council for WalesCancer Research UKDiamond Light Source
Mots-clésSialic acidVirologyBiologySerotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Adenoviruses are clinically important agents. They cause respiratory distress, gastroenteritis, and epidemic keratoconjunctivitis (EKC). As non-enveloped, double stranded DNA viruses, they are easily manipulated, making them popular vectors for therapeutic applications, including vaccines. Species D adenovirus serotype 26 (HAdV-D26) is both a cause of EKC and other disease, and a promising vaccine vector. HAdV-D26 derived vaccines are under investigation as protective platforms against HIV, Zika, RSV infections and are in Phase-III clinical trials for Ebola. We recently demonstrated that HAdV-D26 does not utilise CD46 or desmoglein 2 as entry receptors, whilst the putative interaction with Coxsackie and Adenovirus Receptor (CAR) is low affinity and unlikely to represent the primary cell receptor. Here, we definitively establish sialic acid as the primary entry receptor utilised by HAdV-D26. We demonstrate removal of cell surface sialic acid inhibits HAdV-D26 infection and provide a high-resolution crystal structure of HAdV-D26 fiber-knob in complex with sialic acid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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